RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ABCG8	Q9H221	673 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TUBB1	Q9H4B7	451 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SNX7	Q9UNH6	387 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SNX6	Q9UNH7	406 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ARHGAP33	O14559	1287 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SEC22B	O75396	215 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	OR56A5	P0C7T3	313 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MAG	P20916	626 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CD72	P21854	359 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SLC9A3	P48764	834 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	DIO3	P55073	304 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TIGD6	Q17RP2	521 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MLIP	Q5VWP3	458 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SBSN	Q6UWP8	590 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	KRT73	Q86Y46	540 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FBXL6	Q8N531	539 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SCAMP4	Q969E2	229 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PITX2	Q99697	317 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM245	Q9H330	911 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	VPS4A	Q9UN37	437 aa		14.72	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC182	A6NF36	153 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659		C9JVG2	144 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PPP6C	O00743	305 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GSTM1	P09488	218 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00032	P0C843	101 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GADD45A	P24522	165 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ITGB7	P26010	798 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	AGTR2	P50052	363 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	TEK	Q02763	1124 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	IKZF1	Q13422	519 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LIPI	Q6XZB0	460 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO30	Q8TB52	745 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	FAM162A	Q96A26	154 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ARRDC3	Q96B67	414 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	ELSPBP1	Q96BH3	223 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	KXD1	Q9BQD3	176 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	RIOK2	Q9BVS4	552 aa	Known RBP	14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	LTB4R2	Q9NPC1	389 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	PCTP	Q9UKL6	214 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		14.71	□□□□□ -0.05
BBS1-225	ENST00000630659	COL4A3	Q01955	1670 aa		14.71	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659		A0A0X1KG70	313 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	C1QB	P02746	253 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LCK	P06239	509 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ELFN1	P0C7U0	828 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CBSL	P0DN79	551 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	UROS	P10746	265 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	AKT1	P31749	480 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CBS	P35520	551 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LIPA	P38571	399 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LIMK1	P53667	647 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	UFM1	P61960	85 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SCN1B	Q07699	218 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ASAH1	Q13510	395 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF284	Q2VY69	593 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ENPP6	Q6UWR7	440 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LYPD8	Q6UX82	237 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	OR8H2	Q8N162	312 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	VWA5B2	Q8N398	1253 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CHCHD4	Q8N4Q1	142 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	SUSD6	Q92537	303 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	RHBDF1	Q96CC6	855 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	CRELD1	Q96HD1	420 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF583	Q96ND8	569 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	FAM129B	Q96TA1	746 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		14.7	□□□□□ -0.06
BBS1-225	ENST00000630659	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.7	□□□□□ -0.06

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