RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFAIP8O95379 198 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GUCA1CO95843 209 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX5P17844 614 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HK2P52789 917 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PRKAA2P54646 552 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MAP7Q14244 749 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL35Q6PF15 583 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TBC1D21Q8IYX1 336 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CATSPER1Q8NEC5 780 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NKD1Q969G9 470 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PYCR2Q96C36 320 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ATG10Q9H0Y0 220 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EPB41L1Q9H4G0 881 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MVB12BQ9H7P6 319 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC88CQ9P219 2028 aa11.98□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 STMND1H3BQB6 276 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NKX2-8O15522 239 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC16A8O95907 504 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SQSTM1Q13501 440 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LY6DQ14210 128 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CSHL1Q14406 222 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM53Q6P2H8 277 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SPESP1Q6UW49 350 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC81Q6ZN84 652 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SHISA5Q8N114 240 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 OR1L3Q8NH93 324 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EME1Q96AY2 570 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MENTQ9BUN1 341 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SYNPO2LQ9H987 977 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 UCK1Q9HA47 277 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 E7ENX8 843 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 QSOX1O00391 747 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FFAR3O14843 346 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GPR42O15529 346 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LIFP15018 202 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GNALP38405 381 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PSME3P61289 254 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HSD11B2P80365 405 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MC2RQ01718 297 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PHKG1Q16816 387 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R3BQ86XI6 285 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM126BQ8IUX1 230 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 AMER2Q8N7J2 671 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CEP70Q8NHQ1 597 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 EXTL1Q92935 676 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 LINGO1Q96FE5 620 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PKP4Q99569 1192 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 GALNT8Q9NY28 637 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC167Q9P0B6 97 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DKK4Q9UBT3 224 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SNX5Q9Y5X3 404 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MED13Q9UHV7 2174 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM58BPP0C7Q3 252 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 COL6A2P12110 1019 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 RAB28P51157 221 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SP140Q13342 867 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP1R3AQ16821 1122 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 AMIGO2Q86SJ2 522 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 CNTN4Q8IWV2 1026 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 SYTL1Q8IYJ3 562 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 HMGCLL1Q8TB92 370 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TCF12Q99081 682 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa11.96□□□□□ -0.49
RABGEF1-209ENST00000607882 TRPC5OSA6NMA1 111 aa11.96□□□□□ -0.5
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf74A8MZ97 194 aa11.96□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms