RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000603038.1

CHCHD2P3-201, Transcript of coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 2 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene CHCHD2P3, Length 451 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KRT78Q8N1N4 520 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 STAG3L4Q8TBR4 150 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 WDR34Q96EX3 536 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 F2RL3Q96RI0 385 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LPAR4Q99677 370 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 HES7Q9BYE0 225 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CD244Q9BZW8 370 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RNF32Q9H0A6 362 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MMP25Q9NPA2 562 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 OSGIN2Q9Y236 505 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CLDN16Q9Y5I7 305 aa14.72□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 A1L4Q6 167 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 WIPF3A6NGB9 483 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 URADA6NGE7 173 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LRRC14BA6NHZ5 514 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SH3BGRLO75368 114 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CLEC3AO75596 197 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LDLRP01130 860 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MST1P26927 711 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CRABP2P29373 138 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PPP2R1BP30154 601 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CD96P40200 585 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PMP22Q01453 160 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CHIT1Q13231 466 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TUBA3CQ13748 450 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 EXT1Q16394 746 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PDK4Q16654 411 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TUBA3EQ6PEY2 450 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 UBE3DQ7Z6J8 389 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RNF175Q8N4F7 328 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ELP5Q8TE02 316 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ZNF354BQ96LW1 612 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SLX1AQ9BQ83 275 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NMRAL1Q9HBL8 299 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ACOT9Q9Y305 439 aa14.71□□□□□ -0.05
CHCHD2P3-201ENST00000603038 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CACNA1DQ01668 2161 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SUPT3HB4E1H0 165 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PRAMEF2O60811 474 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SUPT3HO75486 399 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 EDN3P14138 238 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 JAK1P23458 1154 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TDGF1P3P51864 188 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 AP2B1P63010 937 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 IRF8Q02556 426 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NAB1Q13506 487 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ADPRMQ3LIE5 342 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SPINK14Q6IE38 97 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ABHD17CQ6PCB6 329 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FAM180AQ6UWF9 173 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 BCORP1Q8N888 145 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 TTLQ8NG68 377 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 FAR2Q96K12 515 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 GPR78Q96P69 363 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 EHD1Q9H4M9 534 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PRDM7Q9NQW5 492 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SNX15Q9NRS6 342 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 OLAHQ9NV23 265 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 NUDT4Q9NZJ9 180 aa14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 RTCAO00442 366 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KERAO60938 352 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 S100BP04271 92 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CERS1P27544 350 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 COL8A1P27658 744 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 ECHS1P30084 290 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 CASP2P42575 452 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 KCNK10P57789 538 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 SKP1P63208 163 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 E2F2Q14209 437 aa14.69□□□□□ -0.06
CHCHD2P3-201ENST00000603038 MEP1AQ16819 746 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms