RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592580.5

ERMARD-215, Transcript of ER membrane associated RNA degradation, human

TSL 4

Gene ERMARD, Length 568 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERMARD-215	ENST00000592580	NSDHL	Q15738	373 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ATCAY	Q86WG3	371 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	AMER2	Q8N7J2	671 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SNX31	Q8N9S9	440 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	OR2L5	Q8NG80	312 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	M1AP	Q8TC57	530 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TSLP	Q969D9	159 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	L2HGDH	Q9H9P8	463 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MMP25	Q9NPA2	562 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	LUZP4	Q9P127	313 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	OPTC	Q9UBM4	332 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		12.07	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	KRT38	O76015	456 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SCEL	O95171	688 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	GCA	P28676	217 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SERPINB1	P30740	379 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MSH2	P43246	934 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TNFSF10	P50591	281 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	BTN3A2	P78410	334 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ZNF169	Q14929	603 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TLR1	Q15399	786 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EXT1	Q16394	746 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SFT2D3	Q587I9	215 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	KLC3	Q6P597	504 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EIF1AD	Q8N9N8	165 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	OR7G3	Q8NG95	312 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EXT2	Q93063	718 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	UBE2E3	Q969T4	207 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	C19orf60	Q96EN9	201 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MS4A8	Q9BY19	250 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ILKAP	Q9H0C8	392 aa	Predicted RBP	12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EPB41L4B	Q9H329	900 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	FETUB	Q9UGM5	382 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		12.06	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	GTF3C1	Q12789	2109 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580		A0A088AWK7	358 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	FAM227A	F5H4B4	570 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	CYR61	O00622	381 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	RIPK2	O43353	540 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PRMT3	O60678	531 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	UGDH	O60701	494 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	RBP1	P09455	135 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	EPB42	P16452	691 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	GLRB	P48167	497 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	RAB38	P57729	211 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	BTG2	P78543	158 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	LIPJ	Q5W064	366 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	MED27	Q6P2C8	311 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ADGRD1	Q6QNK2	874 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	LINC00696	Q6ZRV3	163 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ELP5	Q8TE02	316 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	FAR2	Q96K12	515 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	F2RL3	Q96RI0	385 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	SERINC2	Q96SA4	455 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	LPAR4	Q99677	370 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	VPS11	Q9H270	941 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ASF1B	Q9NVP2	202 aa		12.05	□□□□□ -0.48
ERMARD-215	ENST00000592580	ZNF358	Q9NW07	568 aa		12.05	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms