RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP2	P42575	452 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	OR4D2	P58180	307 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BTN3A2	P78410	334 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TBCC	Q15814	346 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	XKR6	Q5GH73	641 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MROH9	Q5TGP6	573 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX31	Q8N9S9	440 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	UBTD2	Q8WUN7	234 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NXNL1	Q96CM4	212 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	QRFPR	Q96P65	431 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ACOT9	Q9Y305	439 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CCNT2	O60583	730 aa	Known RBP	20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	C2	P06681	752 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	UQCRH	P07919	91 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	GP1BB	P13224	206 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	EDN3	P14138	238 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MAOA	P21397	527 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ECHS1	P30084	290 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC26A5	P58743	744 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF9	Q00978	393 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PCDH1	Q08174	1060 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BMPR2	Q13873	1038 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RUNX2	Q13950	521 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	INA	Q16352	499 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ACER2	Q5QJU3	275 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ELP5	Q8TE02	316 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	EXT2	Q93063	718 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	KCNK13	Q9HB14	408 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SNX15	Q9NRS6	342 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		20.43	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A0G2JN53	185 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	WIPF3	A6NGB9	483 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	UBXN8	O00124	270 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ERI3	O43414	337 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MAN1A2	O60476	641 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CHIT1	Q13231	466 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BEST3	Q8N1M1	668 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BCORP1	Q8N888	145 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	OR2L5	Q8NG80	312 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CCT6B	Q92526	530 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF592	Q92610	1267 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	FAR2	Q96K12	515 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		20.42	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200		A0A087X1B8	175 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC189	A1A4V9	331 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ALDOA	P04075	364 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PHB	P35232	272 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	IRF8	Q02556	426 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	LAPTM5	Q13571	262 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MEP1A	Q16819	746 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	LGI4	Q8N135	537 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR78	Q96P69	363 aa		20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	20.41	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PRAMEF2	O60811	474 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT3H	O75486	399 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TDGF1P3	P51864	188 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G16	P53816	162 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MNS1	Q8NEH6	495 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	OLAH	Q9NV23	265 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		20.4	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200		K7EPI3	171 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	KLHL2	O95198	593 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	DDAH2	O95865	285 aa		20.39	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	20.39	■□□□□ 0.85
PPP4C-205	ENST00000563200	TUBA3C	Q13748	450 aa		20.39	■□□□□ 0.85

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