RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 FAM47BQ8NA70 645 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CHTF18Q8WVB6 975 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 AGAP4Q96P64 663 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 THAP2Q9H0W7 228 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PDLIM7Q9NR12 457 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CORO2BQ9UQ03 480 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MTMR11A4FU01 709 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WASHC1A8K0Z3 465 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WASH3PC4AMC7 463 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 E9PAM4 449 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC28A1O00337 649 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RP2O75695 350 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ADRB2P07550 413 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CFHP08603 1231 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HOXA9P31269 272 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IFNGR2P38484 337 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CCR4P51679 360 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DAOAP59103 153 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DCDC1P59894 354 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CACNG1Q06432 222 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SNTA1Q13424 505 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CSHL1Q14406 222 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ELP2Q6IA86 826 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WASH2PQ6VEQ5 465 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC39A11Q8N1S5 342 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PYROXD2Q8N2H3 581 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0895Q8NCT3 520 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NUS1Q96E22 293 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MED8Q96G25 268 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PCED1BQ96HM7 432 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LRCH3Q96II8 777 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C16orf70Q9BSU1 422 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DPEP2Q9H4A9 486 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM8Q9NQV8 689 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RNF24Q9Y225 148 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ASF1AQ9Y294 204 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HEPACAM2A8MVW5 462 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 H0YIV9 168 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIP5K1CO60331 668 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FAM20BO75063 409 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TBX10O75333 385 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ME2P23368 584 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 HOXC12P31275 282 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPL22P35268 128 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CASP3P42574 277 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GPR15P49685 360 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ALDH3A2P51648 485 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPS21P63220 83 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TAP2Q03519 686 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 KCNC4Q03721 635 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC18A2Q05940 514 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PMS2P3Q13401 168 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 TOR2AQ5JU69 321 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LYSMD4Q5XG99 296 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 WDR59Q6PJI9 974 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RETREG3Q86VR2 466 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP82Q8N141 532 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR2L2Q8NH16 312 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 NAT6Q93015 286 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC19Q96DA6 116 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SGIP1Q9BQI5 828 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MENTQ9BUN1 341 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 MROQ9BYG7 248 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GSKIPQ9P0R6 139 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 LHX6Q9UPM6 363 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 ASTN1O14525 1302 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PPQ1 181 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CHADO15335 359 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 OR6A2O95222 327 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 FUCA1P04066 466 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 STSP08842 583 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CREB1P16220 341 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 E2F1Q01094 437 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 CHRNB3Q05901 458 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 RING1Q06587 406 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 SLC14A2Q15849 920 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRB-210ENST00000551525 GPR33Q49SQ1 333 aa6.09□□□□□ -1.43
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