RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 ARAP2Q8WZ64 1704 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AKAP11Q9UKA4 1901 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BTN3A3O00478 584 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TPST1O60507 370 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MT-CO1P00395 513 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ITGB2P05107 769 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PTPN4P29074 926 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TTKP33981 857 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AHRP35869 848 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TPMTP51580 245 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HERVK_113P63132 956 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CSNK2BP67870 215 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CTBSQ01459 385 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC14A1Q13336 389 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PTCHD3Q3KNS1 767 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LIN52Q52LA3 116 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 DHRSXQ8N5I4 330 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 AP3S1Q92572 193 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL8Q96CD0 374 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ERVK-6Q9BXR3 956 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC6A16Q9GZN6 736 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC7A11Q9UPY5 501 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FANCGO15287 622 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RAB36O95755 333 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ACADSP16219 412 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TEAD1P28347 426 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR2B6P58173 313 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TAS2R39P59534 338 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PCBD1P61457 104 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RBBP4Q09028 425 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SPEM2Q0P670 501 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CTC1Q2NKJ3 1217 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC30A6Q6NXT4 461 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CNTD1Q8N815 330 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR52E4Q8NGH9 312 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FRMD6Q96NE9 622 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CCT8L2Q96SF2 557 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BTRCQ9Y297 605 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TRBC2A0A5B9 178 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ELOVL7A1L3X0 281 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OR6C65A6NJZ3 312 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LRATO95237 230 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NMBRP28336 390 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC1A2P43004 574 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CACNA2D1P54289 1103 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PSME3P61289 254 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HTR4Q13639 388 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OASLQ15646 514 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NOXRED1Q6NXP6 359 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NLRP8Q86W28 1048 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 APCDD1Q8J025 514 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC19A3Q9BZV2 496 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CD244Q9BZW8 370 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 OARD1Q9Y530 152 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FAM25AB3EWG3 89 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FAM25CB3EWG5 89 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FAM25GB3EWG6 89 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BPGMP07738 259 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CD9P21926 228 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NR4A1P22736 598 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 PRDX6P30041 224 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 CLRN1P58418 232 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 WDR5BQ86VZ2 330 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TDRPQ86YL5 185 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ANKRD27Q96NW4 1050 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 DOHHQ9BU89 302 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 KLHL1Q9NR64 748 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 MYH1P12882 1939 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 A0A1W2PQ72 361 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 ISPDA4D126 451 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 HTR3EA5X5Y0 456 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 B4GAT1O43505 415 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 NIPSNAP2O75323 286 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 LINC00032P0C843 101 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRB-209ENST00000550857 TAF1P21675 1872 aa7.74□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38 ms