RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 F8W036 122 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MEN1O00255 615 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 STK25O00506 426 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NME4O00746 187 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MID1O15344 667 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TAPBPO15533 448 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PGRP06401 933 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ACP5P13686 325 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GJA4P35212 333 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 IL12RB1P42701 662 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 KIR3DL1P43629 444 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CSRP3P50461 194 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ARFIP1P53367 373 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 EPHA5P54756 1037 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GPLD1P80108 840 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BNIP2Q12982 314 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BNIP3Q12983 259 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRAF3Q13114 568 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PLBD1Q6P4A8 553 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ADCK1Q86TW2 530 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SFTPA1Q8IWL2 248 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM68Q96MH6 324 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CMTM3Q96MX0 182 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CHID1Q9BWS9 393 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC12A9Q9BXP2 914 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 FBXL12Q9NXK8 326 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZIM2Q9NZV7 527 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GPR45Q9Y5Y3 372 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AP4B1Q9Y6B7 739 aa7.56□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C5orf42Q9H799 3197 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 K7ESM1 405 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LATO43561 262 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LDLRP01130 860 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TGFB1P01137 390 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCNA2P20248 432 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HPCAL1P37235 193 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ATP4BP51164 291 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RACK1P63244 317 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 B4GALNT1Q00973 533 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RHDQ02161 417 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CNTN1Q12860 1018 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ADGRE1Q14246 886 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PERM1Q5SV97 790 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf52Q5T4I8 152 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SYCE2Q6PIF2 218 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ZER1Q7Z7L7 766 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MICU2Q8IYU8 434 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 TBC1D19Q8N5T2 526 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 KCT2Q8NC54 265 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ASB11Q8WXH4 323 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CHFRQ96EP1 664 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 IL17FQ96PD4 163 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 C12orf57Q99622 126 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ING2Q9H160 280 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 NANOGQ9H9S0 305 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HMG20AQ9NP66 347 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MIEF1Q9NQG6 463 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GMPPBQ9Y5P6 360 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 A0A1W2PRG6 482 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CENPXA8MT69 81 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ARHGEF33A8MVX0 844 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CLDN25C9JDP6 229 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ARPC2O15144 300 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SNX4O95219 450 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 BCKDHAP12694 445 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 F8A1P23610 371 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SLC6A2P23975 617 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MMP12P39900 470 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 HTR2BP41595 481 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 VAC14Q08AM6 782 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 SF1Q15637 639 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 INAVAQ3KP66 663 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 AADACL4Q5VUY2 407 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 OR6S1Q8NH40 331 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 PROKR1Q8TCW9 393 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 MAGEE2Q8TD90 523 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 RSPRY1Q96DX4 576 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 LMAN2LQ9H0V9 348 aa7.55□□□□□ -1.2
TRPS1-208ENST00000519076 GDE1Q9NZC3 331 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms