RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516127.1

RNA5SP249-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 249, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP249, Length 99 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP249-201ENST00000516127 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ICKQ9UPZ9 632 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MGAT4BQ9UQ53 548 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CCL26Q9Y258 94 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ASF1AQ9Y294 204 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SNX8Q9Y5X2 465 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 A3GALT2U3KPV4 340 aa4.7□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 THSD7BQ9C0I4 1608 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TRBC2A0A5B9 178 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 IRGMA1A4Y4 181 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PIPSLA2A3N6 862 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 FUOMA2VDF0 154 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 OR2A25A4D2G3 310 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ARRDC5A6NEK1 342 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PDZK1P1A8MUH7 402 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 J3QRK9 145 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 KIAA0355O15063 1070 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 NPC1O15118 1278 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 KMOO15229 486 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TBX19O60806 448 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MMP20O60882 483 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TNFRSF21O75509 655 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SULT1C4O75897 302 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SEMA3DO95025 777 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 VIPP01282 170 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CDK1P06493 297 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 HTR1AP08908 422 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 NUDT7P0C024 238 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CISD3P0C7P0 127 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ARAFP10398 606 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ETFAP13804 333 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DRD2P14416 443 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PORP16435 677 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CD22P20273 847 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DDCP20711 480 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CD247P20963 164 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 NR4A1P22736 598 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PDHA2P29803 388 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CD40LGP29965 261 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PPP2R1BP30154 601 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CTNNB1P35222 781 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 IRS1P35568 1242 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 IFNGR2P38484 337 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MMP12P39900 470 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 OPRL1P41146 370 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CTSKP43235 329 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 IDH2P48735 452 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PXNP49023 591 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 VEGFBP49765 207 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PSMD7P51665 324 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PPP5CP53041 499 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MAPK12P53778 367 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CRISP1P54107 249 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DEFA1P59665 94 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DEFA3P59666 94 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ERVFC1P60507 584 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 VBP1P61758 197 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 LSM3P62310 102 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TBPL1P62380 186 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 HBA1P69905 142 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF45Q02386 682 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TAP2Q03519 686 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TGM3Q08188 693 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 PDE7AQ13946 482 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DGCR6Q14129 220 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 E2F2Q14209 437 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 LAPTM4AQ15012 233 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 NCF4Q15080 339 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SF1Q15637 639 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CTF1Q16619 201 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TIGD6Q17RP2 521 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TBC1D25Q3MII6 688 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 POM121L1PQ3SYA9 428 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ZNF404Q494X3 552 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 COLEC12Q5KU26 742 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CATSPEREQ5SY80 951 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DCST1Q5T197 706 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 MEDAGQ5VYS4 303 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 LAIR2Q6ISS4 152 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 GPR153Q6NV75 609 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 CASP12Q6UXS9 341 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
RNA5SP249-201ENST00000516127 OTOP2Q7RTS6 562 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.9 ms