RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515295.5

POLK-217, Transcript of DNA polymerase kappa, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene POLK, Length 1,438 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLK-217ENST00000515295 FUT1P19526 365 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 AGAP20933 346 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PSMB6P28072 239 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 GNA11P29992 359 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CSNK1DP48730 415 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NDST2P52849 883 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 UCP2P55851 309 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RAE1P78406 368 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PPP2R2BQ00005 443 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RHAGQ02094 409 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CFHR1Q03591 330 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CACNG1Q06432 222 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZNF33AQ06730 810 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CDH17Q12864 832 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PRKAA1Q13131 559 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MVPQ14764 893 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SHBQ15464 509 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SSX2Q16385 188 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PPP1R3AQ16821 1122 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SLC5A12Q1EHB4 618 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 AP5B1Q2VPB7 878 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TEX44Q53QW1 395 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 BEX5Q5H9J7 111 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 Q5PR19 223 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MANEAQ5SRI9 462 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 C1orf146Q5VVC0 180 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MLIPQ5VWP3 458 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NKAIN2Q5VXU1 208 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SLC25A25Q6KCM7 469 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 DLK2Q6UY11 383 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 LINC00523Q86TU6 105 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CYP4Z1Q86W10 505 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PLA2G4DQ86XP0 818 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NRROSQ86YC3 692 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 GID4Q8IVV7 300 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TIGD4Q8IY51 512 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ADGRF4Q8IZF3 695 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SLC38A6Q8IZM9 456 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TRAM1L1Q8N609 369 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NECAB1Q8N987 351 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 FAM47BQ8NA70 645 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 IL17RCQ8NAC3 791 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CAMKVQ8NCB2 501 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 OR52L2PQ8NGH6 319 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 EXD1Q8NHP7 514 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NCOA7Q8NI08 942 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZNF596Q8TC21 504 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MCOLN3Q8TDD5 553 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PROX1Q92786 737 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RAB1CQ92928 201 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CD101Q93033 1021 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MYDGFQ969H8 173 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ERLEC1Q96DZ1 483 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PERPQ96FX8 193 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 LYZL4Q96KX0 146 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TAAR1Q96RJ0 339 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RANBP9Q96S59 729 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 GPA33Q99795 319 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PIGQQ9BRB3 760 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 NUP58Q9BVL2 599 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SCNM1Q9BWG6 230 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 OSBPL8Q9BZF1 889 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 FBXO44Q9H4M3 255 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 SLC32A1Q9H598 525 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 MMP25Q9NPA2 562 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 TREX1Q9NSU2 369 aa3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
POLK-217ENST00000515295 ABHD10Q9NUJ1 306 aa3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms