RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 LYRM4Q9HD34 91 aa13.77□□□□□ -0.21
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SH3BP2-208ENST00000504294 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP13.74□□□□□ -0.21
SH3BP2-208ENST00000504294 GRK2P25098 689 aa13.74□□□□□ -0.21
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SH3BP2-208ENST00000504294 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP13.74□□□□□ -0.21
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