RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 BRD3Q15059 726 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TSTD2Q5T7W7 516 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FIGLAQ6QHK4 219 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 KIRREL2Q6UWL6 708 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC00523Q86TU6 105 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 KCNMB4Q86W47 210 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TICAM1Q8IUC6 712 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 VRK3Q8IV63 474 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PPP4R1Q8TF05 950 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ELMO1Q92556 727 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HDAC10Q969S8 669 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZUFSPQ96AP4 578 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF778Q96MU6 729 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM121Q9BTD3 319 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CARD6Q9BX69 1037 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CSAG2Q9Y5P2 127 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TACC2O95359 2948 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FBN2P35556 2912 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1B0GX78 115 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HEATR9A2RTY3 570 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ISM1B1AKI9 464 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 E2F3O00716 465 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DSCR3O14972 297 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CTSVO60911 334 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ITGA10O75578 1167 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 GOT2P00505 430 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CD9P21926 228 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ADRA1DP25100 572 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PTGS2P35354 604 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CETN2P41208 172 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 GRIA1P42261 906 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 GRIA3P42263 894 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 Q0VFX4 171 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CDH17Q12864 832 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SEMA3AQ14563 771 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OASLQ15646 514 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 P3H1Q32P28 736 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC38Q502W7 563 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TCTE1Q5JU00 501 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ATG9BQ674R7 924 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 UNC5DQ6UXZ4 953 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HOOK3Q86VS8 718 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR52K1Q8NGK4 314 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR2L8Q8NGY9 312 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR4L1Q8NH43 312 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HMGCLL1Q8TB92 370 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DENND1AQ8TEH3 1009 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 COG1Q8WTW3 980 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF480Q8WV37 535 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SNX33Q8WV41 574 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ASZ1Q8WWH4 475 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TM9SF4Q92544 642 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX13Q92968 403 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A18Q96BI1 424 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC45Q96CN5 670 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 HES6Q96HZ4 224 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 NDC1Q9BTX1 674 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TXLNGQ9NUQ3 528 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FBXL4Q9UKA2 621 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FER1L5A0AVI2 2057 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 POLQO75417 2590 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PPV9 198 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 A0A1W2PQ72 361 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC78A2IDD5 438 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 IQCF5A8MTL0 148 aa6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RASGRF2O14827 1237 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms