RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488426.5

NELFE-209, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 1,855 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-209ENST00000488426 TRPV3Q8NET8 790 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 WDR48Q8TAF3 677 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CREB3L4Q8TEY5 395 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PATE1Q8WXA2 126 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 MTERF3Q96E29 417 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 SH3GL1Q99961 368 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 SPASTQ9UBP0 616 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ATP6V1HQ9UI12 483 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ADAM29Q9UKF5 820 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa12.13□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 C2orf74A8MZ97 194 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 HAT1O14929 419 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 NDUFS4O43181 175 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TNFSF14O43557 240 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 AKAP10O43572 662 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PCDHGA12O60330 932 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 BCL6P41182 706 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TRPC1P48995 793 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CCT8P50990 548 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PHC1P78364 1004 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 HHEXQ03014 270 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 LRRC74AQ0VAA2 488 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ZIC1Q15915 447 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TMEM26Q6ZUK4 368 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PAQR7Q86WK9 346 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 MFSD9Q8NBP5 474 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 FAM156AQ8NDB6 213 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CDC26Q8NHZ8 85 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 SLC26A7Q8TE54 656 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 C16orf78Q8WTQ4 265 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GATA6Q92908 595 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 RGMAQ96B86 450 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PPM1MQ96MI6 270 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ANKRD27Q96NW4 1050 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 OR2A14Q96R47 310 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ALG2Q9H553 416 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 REEP4Q9H6H4 257 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 S100A14Q9HCY8 104 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 SERHLQ9NQF3 203 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ACTR10Q9NZ32 417 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 KLK4Q9Y5K2 254 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 DSPP15924 2871 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CROCCQ5TZA2 2017 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 OR6C74A6NCV1 312 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 FLRT2O43155 660 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ZW10O43264 779 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 KLK1P06870 262 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 UGT2B7P16662 529 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 BSGP35613 385 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GRIA3P42263 894 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GSK3BP49841 420 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 LIPEQ05469 1076 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PDE7AQ13946 482 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 SLC5A12Q1EHB4 618 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CCDC157Q569K6 752 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 RABL3Q5HYI8 236 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 CPTPQ5TA50 214 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ANXA8L1Q5VT79 327 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 OR4F3Q6IEY1 312 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 FAM71E1Q6IPT2 247 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ZFP1Q6P2D0 407 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GLRX5Q86SX6 157 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PLD3Q8IV08 490 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 FAM20CQ8IXL6 584 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 COQ8BQ96D53 544 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 F2RL3Q96RI0 385 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TRIM15Q9C019 465 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ATAD3AQ9NVI7 634 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 VAPAQ9P0L0 249 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 STOML1Q9UBI4 398 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 PTPRBP23467 1997 aa12.12□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 ARHGAP10A1A4S6 786 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 GSAPA4D1B5 854 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 OR2A25A4D2G3 310 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 LRIT2A6NDA9 550 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 B4DGG1 531 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 DFNA5O60443 496 aa12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
NELFE-209ENST00000488426 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms