RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475558.5

SHQ1-207, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 666 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-207ENST00000475558 DPY30Q9C005 99 aa6.71□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 RMND5AQ9H871 391 aa6.71□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ASCL3Q9NQ33 180 aa6.71□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 ATAD3AQ9NVI7 634 aa6.71□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 MS4A12Q9NXJ0 267 aa6.71□□□□□ -1.34
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SHQ1-207ENST00000475558 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 SPACA6W5XKT8 324 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 PTPN13Q12923 2485 aa6.7□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 GSAPA4D1B5 854 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 OR2A25A4D2G3 310 aa6.69□□□□□ -1.34
SHQ1-207ENST00000475558 LRIT2A6NDA9 550 aa6.69□□□□□ -1.34
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