RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 TNFRSF21O75509 655 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 EGFP01133 1207 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 DDCP20711 480 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 COL9A1P20849 921 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 ELK4P28324 431 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 BSGP35613 385 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 PIGAP37287 484 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 HTR4Q13639 388 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 CLCA4Q14CN2 919 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM40Q6P9F5 258 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 ADCK2Q7Z695 626 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 MMP21Q8N119 569 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 MYOCQ99972 504 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 XKR8Q9H6D3 395 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 ACSL6Q9UKU0 697 aa16.4■□□□□ 0.22
FAAP20-211ENST00000469733 SLC31A1O15431 190 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PKLRP30613 574 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SOAT1P35610 550 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HLCSP50747 726 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CRYBA2P53672 197 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ITGA1P56199 1179 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CSNK1G2P78368 415 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RBBP4Q09028 425 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GPR141Q7Z602 305 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR2L8Q8NGY9 312 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MVB12BQ9H7P6 319 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SCML1Q9UN30 329 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ICKQ9UPZ9 632 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CEP290O15078 2479 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRR19A6NJB7 356 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NDUFS4O43181 175 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DIRAS1O95057 198 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KRT75O95678 551 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 FPR1P21462 350 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IGFBP5P24593 272 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 YAP1P46937 504 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PRIM2P49643 509 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CASP9P55211 416 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LSAMPQ13449 338 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CEP68Q76N32 757 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT13Q86X67 352 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR5AK3PQ8NH89 298 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RGMAQ96B86 450 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TM4SF18Q96CE8 201 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DOHHQ9BU89 302 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM38AQ9H6F2 299 aa16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DDX5P17844 614 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 KCNJ10P78508 379 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SCARB2Q14108 478 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 HEPACAMQ14CZ8 416 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLC5A12Q1EHB4 618 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 UAP1L1Q3KQV9 507 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RNF130Q86XS8 419 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NATD1Q8N6N6 113 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR2A1Q8NGT9 310 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NRBF2Q96F24 287 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 REEP1Q9H902 201 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CLDND1Q9NY35 253 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR52A4PA6NMU1 304 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 DPM1O60762 260 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 TBX19O60806 448 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 UQCRC2P22695 453 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PPP2CBP62714 309 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 PPP2CAP67775 309 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZBED5Q49AG3 693 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 OR52E1Q8NGJ3 308 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SIPA1Q96FS4 1042 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 C7orf34Q96L11 122 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 C1GALT1Q9NS00 363 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ANHXE9PGG2 379 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SLC16A6O15403 523 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CLEC3AO75596 197 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ITGAMP11215 1152 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 GSTM5P46439 218 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 RXRGP48443 463 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 ALDH9A1P49189 494 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 CDK9P50750 372 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 SELENOWP63302 87 aa16.37■□□□□ 0.21
FAAP20-211ENST00000469733 IL18R1Q13478 541 aa16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms