RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 FAM26EQ8N5C1 309 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 HAS2Q92819 552 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 GPR78Q96P69 363 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 RHBGQ9H310 441 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NAV2Q8IVL1 2488 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 DYTNA2CJ06 578 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 SYCE1LA8MT33 242 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 FAM227AF5H4B4 570 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL2O95198 593 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 UQCRHP07919 91 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TYK2P29597 1187 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 CASP2P42575 452 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TNFSF10P50591 281 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 BTG2P78543 158 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 IRF8Q02556 426 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 QSOX2Q6ZRP7 698 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 FAR2Q96K12 515 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 OPTCQ9UBM4 332 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC189A1A4V9 331 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PRMT3O60678 531 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 F10P00742 488 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 OR4D2P58180 307 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 LAPTM5Q13571 262 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ACAP2Q15057 778 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NR6A1Q15406 480 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 EXT1Q16394 746 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 H3F3CQ6NXT2 135 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 CEP112Q8N8E3 955 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 OR2L5Q8NG80 312 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 M1APQ8TC57 530 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PTCHD1Q96NR3 888 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 QRFPRQ96P65 431 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PAFAH2Q99487 392 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 LPAR4Q99677 370 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 RNF32Q9H0A6 362 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 K7EPI3 171 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 WDPCPO95876 746 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 INHBAP08476 426 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 MAOAP21397 527 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEA12P43365 314 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PCDH1Q08174 1060 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 RUNX2Q13950 521 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD17BQ5VST6 288 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 OR1N1Q8NGS0 311 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ISL2Q96A47 359 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 MMP25Q9NPA2 562 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 A8MUI8 341 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 CBX6O95503 412 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PLA2G16P53816 162 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF33BQ06732 778 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 SETDB1Q15047 1291 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD17CQ6PCB6 329 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 GRHL3Q8TE85 626 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 VPS11Q9H270 941 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NECTIN3Q9NQS3 549 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PRDM9Q9NQV7 894 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NFU1Q9UMS0 254 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 KLK8O60259 260 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 SLC26A5P58743 744 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 PFKFB4Q16877 469 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 FCRLBQ6BAA4 426 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 KLC3Q6P597 504 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM40Q6P9F5 258 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 F2RL3Q96RI0 385 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 NPAS2Q99743 824 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 KCNK13Q9HB14 408 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 STMN3Q9NZ72 180 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 A0A088AWK7 358 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 B3GALT2O43825 422 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 GFAPP14136 432 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 EPB42P16452 691 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 MSH2P43246 934 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINB9P50453 376 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ACER2Q5QJU3 275 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 LAS2Q8IYD9 372 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 TEX9Q8N6V9 391 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-202ENST00000460160 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms