RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447117.1

PTENP1-201, Transcript of phosphatase and tensin homolog pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PTENP1, Length 1,215 nt, Biotype transcribed processed pseudogene, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP1-201ENST00000447117 SPEM1Q8N4L4 309 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 EXOC4Q96A65 974 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CCM2Q9BSQ5 444 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PILRAQ9UKJ1 303 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GPR132Q9UNW8 380 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PLCL2Q9UPR0 1127 aa3.56□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GLTPD2A6NH11 291 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ARHGEF33A8MVX0 844 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RAD51DO75771 328 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 FGF19O95750 216 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ANGPTL1O95841 491 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SELEP16581 610 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CAPN2P17655 700 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 IL4RP24394 825 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ETV5P41161 510 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SRPXP78539 464 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ABRQ12979 859 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MAPK11Q15759 364 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 KRT71Q3SY84 523 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF841Q6ZN19 808 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CARM1Q86X55 608 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CATSPER3Q86XQ3 398 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 KLHL7Q8IXQ5 586 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 NHLRC2Q8NBF2 726 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ATAD1Q8NBU5 361 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF597Q96LX8 424 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 C17orf62Q9BQA9 187 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PINK1Q9BXM7 581 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 VIPAS39Q9H9C1 493 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MRGBPQ9NV56 204 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 TMOD3Q9NYL9 352 aa3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SERINC4A6NH21 518 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ANKDD1BA6NHY2 528 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SDR42E2A6NKP2 422 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF732B4DXR9 585 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PSMA7O14818 248 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MLNRO43193 412 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 STX6O43752 255 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ACSL4O60488 711 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CLN5O75503 358 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SRD5A2P31213 254 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RPL9P32969 192 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 KRT2P35908 639 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CLCN4P51793 760 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 PRELPP51888 382 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SCARB2Q14108 478 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SIAH3Q8IW03 269 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 SLC39A11Q8N1S5 342 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RNF149Q8NC42 400 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 TOMM40LQ969M1 308 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CCDC114Q96M63 670 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 JPT2Q9H910 190 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 TUFT1Q9NNX1 390 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MIS18AQ9NYP9 233 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GMEB2Q9UKD1 530 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GTF3C4Q9UKN8 822 aa3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 AGRNO00468 2067 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 BCL2L11O43521 198 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ADORA3P0DMS8 318 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ITIH1P19827 911 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 FRKP42685 505 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RIDAP52758 137 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 BTG1P62324 171 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ARHGAP1Q07960 439 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CD300CQ08708 224 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 COX10Q12887 443 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 GPR50Q13585 617 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF774Q6NX45 483 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 C11orf88Q6PI97 169 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 TDHQ8IZJ6 230 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 ELMOD1Q8N336 334 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 UXS1Q8NBZ7 420 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 OR13C5Q8NGS8 318 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 RASL10BQ96S79 203 aa3.53□□□□□ -1.84
PTENP1-201ENST00000447117 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms