RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	ENO1	P06733	434 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCNA	P12004	261 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CPA3	P15088	417 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MTTP	P55157	894 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PKNOX1	P55347	436 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SOX8	P57073	446 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RAB8A	P61006	207 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	AP2B1	P63010	937 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LCP2	Q13094	533 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CUL3	Q13618	768 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ATP1A4	Q13733	1029 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF10	Q5QP82	559 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FRG2	Q64ET8	278 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCSK4	Q6UW60	755 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CLEC1A	Q8NC01	280 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	QRFPR	Q96P65	431 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FRG2B	Q96QU4	278 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LYRM4	Q9HD34	91 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ACSS2	Q9NR19	701 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SNX6	Q9UNH7	406 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ATM	Q13315	3056 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SCN2A	Q99250	2005 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FOXO6	A8MYZ6	492 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CHST10	O43529	356 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ALOX12B	O75342	701 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CEACAM4	O75871	244 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HP	P00738	406 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FH	P07954	510 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MYZAP	P0CAP1	466 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HSD3B1	P14060	373 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ACPP	P15309	386 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HSD3B2	P26439	372 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	BTN3A2	P78410	334 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	IFT88	Q13099	833 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KCNAB2	Q13303	367 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SYT16	Q17RD7	645 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LIPM	Q5VYY2	423 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	HPS6	Q86YV9	775 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC63	Q8NA47	563 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	METTL21A	Q8WXB1	218 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RGMA	Q96B86	450 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	SERPINI1	Q99574	410 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TRMO	Q9BU70	441 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	VN1R1	Q9GZP7	353 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	C4orf51	C9J302	202 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ESRRB	O95718	433 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KRT6A	P02538	564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KRT6B	P04259	564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	KRT6C	P48668	564 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	PLA2G16	P53816	162 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CDH13	P55290	713 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	RAB38	P57729	211 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TTC19	Q6DKK2	380 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	LETMD1	Q6P1Q0	360 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	FRMD7	Q6ZUT3	714 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	NDUFAF7	Q7L592	441 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	CA13	Q8N1Q1	262 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	ZCCHC7	Q8N3Z6	543 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PTPA-222	ENST00000445241	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		13.8	□□□□□ -0.2

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