RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439424.6

C17orf49-201, Transcript of chromosome 17 open reading frame 49, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene C17orf49, Length 850 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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C17orf49-201ENST00000439424 HECTD1Q9ULT8 2610 aa22.59■■□□□ 1.21
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C17orf49-201ENST00000439424 LPAR4Q99677 370 aa22.58■■□□□ 1.21
C17orf49-201ENST00000439424 EPB41L4BQ9H329 900 aa22.58■■□□□ 1.21
C17orf49-201ENST00000439424 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa22.58■■□□□ 1.21
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C17orf49-201ENST00000439424 ZNF33BQ06732 778 aa22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.57■■□□□ 1.21e-9■■■□□ 18.8
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C17orf49-201ENST00000439424 EXT1Q16394 746 aa22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 ZNF793Q6ZN11 406 aa22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 UBE3DQ7Z6J8 389 aa22.57■■□□□ 1.2
C17orf49-201ENST00000439424 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
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