RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP6V0D1	P61421	351 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CAV1	Q03135	178 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MEP1A	Q16819	746 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CA13	Q8N1Q1	262 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MDS2	Q8NDY4	140 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TTL	Q8NG68	377 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NT5DC2	Q9H857	520 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		16.63	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MTOR	P42345	2549 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TRGV8	A0A0C4DH27	118 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MAN1A2	O60476	641 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PRMT3	O60678	531 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF4	O60810	478 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	B4GALT2	O60909	372 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MYBL2	P10244	700 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PLTP	P55058	493 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB10	P61026	200 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	BTG2	P78543	158 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA3C	Q13748	450 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	OR4D1	Q15615	310 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TRADD	Q15628	312 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GRTP1	Q5TC63	336 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MTFR2	Q6P444	385 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GPSM1	Q86YR5	675 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	LGI4	Q8N135	537 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PDPR	Q8NCN5	879 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1191	Q96A73	305 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	WDR34	Q96EX3	536 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC120	Q96HB5	630 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CAPS2	Q9BXY5	557 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB17	Q9H0T7	212 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	EHD1	Q9H4M9	534 aa		16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	16.62	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	LRIT2	A6NDA9	550 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL21	O00585	134 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CDK2AP1	O14519	115 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CLEC3A	O75596	197 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT38	O76015	456 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	COX6B1	P14854	86 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MST1	P26927	711 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF766	Q5HY98	468 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT1C3	Q6IMI6	304 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	RPTN	Q6XPR3	784 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT78	Q8N1N4	520 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SIGLEC12	Q96PQ1	595 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	DNAJC11	Q9NVH1	559 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	WWOX	Q9NZC7	414 aa		16.61	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SAGE2P	A6NJ88	616 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM227A	F5H4B4	570 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	STK16	O75716	305 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM155B	O75949	473 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	UNC5C	O95185	931 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	EPOR	P19235	508 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MAOA	P21397	527 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CD96	P40200	585 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	CA7	P43166	264 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEA4	P43358	317 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNC1	P48547	511 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	HSPA7	P48741	367 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	GUCY2D	Q02846	1103 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	E2F2	Q14209	437 aa		16.6	■□□□□ 0.25
MRPL28-203	ENST00000429738	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		16.6	■□□□□ 0.25

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms