RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PQU0 124 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 KRT87PA6NCN2 255 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ANTXRLA6NF34 631 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SAC3D1A6NKF1 404 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 GABRR3A8MPY1 467 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 H0YAE9 185 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TOR1BO14657 336 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBX19O60806 448 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 LRATO95237 230 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 HOXB2P14652 356 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CKMT2P17540 419 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 GABRG2P18507 467 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 WASP42768 502 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 RPL5P46777 297 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 RXRGP48443 463 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CLCNKAP51800 687 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ARFIP1P53367 373 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PLIN5Q00G26 463 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MERTKQ12866 999 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PDE7AQ13946 482 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 KRT80Q6KB66 452 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF621Q6ZSS3 439 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF605Q86T29 641 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR7A2PQ8NGA2 310 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR2I1PQ8NGU4 316 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OR14C36Q8NHC7 312 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SNX19Q92543 992 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SH3KBP1Q96B97 665 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SDCCAG3Q96C92 435 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PYURFQ96I23 114 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CNBD2Q96M20 576 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SEPHS2Q99611 448 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 INPP5KQ9BT40 448 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 EBPLQ9BY08 206 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 BTBD1Q9H0C5 482 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PIF1Q9H611 641 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 UBAP1Q9NZ09 502 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM29Q9UKF5 820 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 OAZ3Q9UMX2 235 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 VPS4AQ9UN37 437 aa9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ACACAQ13085 2346 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3EA0A087X179 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PRR19A6NJB7 356 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3LB9A6J9 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SOCS2O14508 198 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TPST1O60507 370 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 DPM1O60762 260 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ADAM23O75077 832 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ETHE1O95571 254 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM5P06731 702 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 LINGO3P0C6S8 592 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3HP0C7X1 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 LAMP1P11279 417 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 MYF6P23409 242 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFS1P28331 727 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 RAB28P51157 221 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ALDH3A2P51648 485 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ADPRHP54922 357 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 KIAA1024LP59773 190 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TUBA4AP68366 448 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 ABATP80404 500 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 RBBP4Q09028 425 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 FGL2Q14314 439 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TEAD4Q15561 434 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 VMACQ2NL98 169 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 SLC36A3Q495N2 470 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 PYCR3Q53H96 274 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 DEPDC1Q5TB30 811 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 FAM71E1Q6IPT2 247 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 WASH2PQ6VEQ5 465 aa9.59□□□□□ -0.87
POLR1A-204ENST00000424089 GPR155Q7Z3F1 870 aa9.59□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.8 ms