RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384085.1

RNU6-38P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-38P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-38P-201ENST00000384085 SP9P0CG40 484 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANPEPP15144 967 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDGFRAP16234 1089 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT20P35900 424 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC1A3P43003 542 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CRKLP46109 303 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR3A3P47888 321 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPL34P49207 117 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PEX3P56589 373 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPA1Q15181 289 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 MAPK11Q15759 364 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF506Q5JVG8 444 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 MUC21Q5SSG8 566 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 FAM46CQ5VWP2 391 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 OLFML2AQ68BL7 652 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 BTNL8Q6UX41 500 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 KRT74Q7RTS7 529 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPATA21Q7Z572 469 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 LRRC49Q8IUZ0 686 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CARNMT1Q8N4J0 409 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q8N7P7 452 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 NCOA7Q8NI08 942 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 HEXDCQ8WVB3 486 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ITLN1Q8WWA0 313 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 APOL2Q9BQE5 337 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLITRK2Q9H156 845 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PDRG1Q9NUG6 133 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 MRGBPQ9NV56 204 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 GMEB2Q9UKD1 530 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 MGAT4AQ9UM21 535 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 KLK4Q9Y5K2 254 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 IGLON5A6NGN9 336 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSPY2A6NKD2 308 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANXA2P2A6NMY6 339 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 DNTTP04053 509 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 LBPP18428 481 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PSMB4P28070 264 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPRP35270 261 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 MATKP42679 507 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 EVCP57679 992 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RBBP4Q09028 425 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNTN1Q12860 1018 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ABRQ12979 859 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 Q1RN00 199 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 POM121L1PQ3SYA9 428 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 NHLRC3Q5JS37 347 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 C16orf54Q6UWD8 224 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CCDC186Q7Z3E2 898 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 OR1B1Q8NGR6 318 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 KIF18AQ8NI77 898 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RFT1Q96AA3 541 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 RADILQ96JH8 1075 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 TSSK2Q96PF2 358 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBQLN3Q9H347 655 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 C5orf66Q9H5L9 145 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PFDN4Q9NQP4 134 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 SH3GLB2Q9NR46 395 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CUTCQ9NTM9 273 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CLEC5AQ9NY25 188 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 THYN1Q9P016 225 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 TTLL3Q9Y4R7 772 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 CPQQ9Y646 472 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-38P-201ENST00000384085 HCFC1P51610 2035 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ZNF732B4DXR9 585 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FBP2O00757 339 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 FCGR3BO75015 233 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 VENTXO95231 258 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 SEMA4FO95754 770 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 ANGPTL1O95841 491 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LDHCP07864 332 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 DLATP10515 647 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRG2P13727 222 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 LYZP61626 148 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PPIAP62937 165 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 NDPQ00604 133 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 CETN1Q12798 172 aa2.27□□□□□ -2.05
RNU6-38P-201ENST00000384085 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms