RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360439.8

SIN3A-201, Transcript of SIN3 transcription regulator family member A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIN3A, Length 5,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3A-201ENST00000360439 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa9.6□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SMCHD1A6NHR9 2005 aa9.6□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LINC00587B1AMM8 73 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SDHDO14521 159 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 UGT2B11O75310 529 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 OTCP00480 354 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CASP9P55211 416 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SKP1P63208 163 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SEMG2Q02383 582 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 GK3PQ14409 553 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MBTPS1Q14703 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PKDCCQ504Y2 493 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 EOGTQ5NDL2 527 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 FAM151BQ6UXP7 276 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RDH12Q96NR8 316 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 TCEAL7Q9BRU2 100 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 IFT27Q9BW83 186 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MROQ9BYG7 248 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SMOC2Q9H3U7 446 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RASSF1Q9NS23 344 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RAD18Q9NS91 495 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SLC22A11Q9NSA0 550 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LRRC14BA6NHZ5 514 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 H0YAE9 185 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ADAM12O43184 909 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HLA-EP13747 358 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 GNSP15586 552 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 IRS1P35568 1242 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 DSC2Q02487 901 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LIPEQ05469 1076 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 GRIK2Q13002 908 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HDAC10Q969S8 669 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MARC2Q969Z3 335 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LRCH3Q96II8 777 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 IL1RAPQ9NPH3 570 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 FAM234BA2RU67 622 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ARGFXA6NJG6 315 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LAMTOR5O43504 91 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ATG12O94817 140 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 THRBP10828 461 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SLC2A4P14672 509 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SCN1BQ07699 218 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 C11orf88Q6PI97 169 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 FAM131AQ6UXB0 335 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MILR1Q7Z6M3 343 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 NAXEQ8NCW5 288 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MED8Q96G25 268 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 C19orf43Q9BQ61 176 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 GLS2Q9UI32 602 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MKLN1Q9UL63 735 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SLC22A7Q9Y694 548 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PGLSO95336 258 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CYP11A1P05108 521 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LINC00032P0C843 101 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 LPOP22079 712 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CEACAM7Q14002 265 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CLINT1Q14677 625 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 TMEM198Q66K66 360 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 C5orf46Q6UWT4 87 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PRSS58Q8IYP2 241 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 KLHL6Q8WZ60 621 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 FGF13Q92913 245 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 ANKRD60Q9BZ19 345 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CAPN10Q9HC96 672 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 SPHK2Q9NRA0 654 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HS3ST4Q9Y661 456 aa9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SIN3A-201ENST00000360439 HS6ST1O60243 411 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 PCCBP05166 539 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 SLC35E2BP0CK96 405 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 BMP2P12643 396 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 CKMT2P17540 419 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 CBLP22681 906 aa9.58□□□□□ -0.88
SIN3A-201ENST00000360439 S100A7P31151 101 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms