RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 AHSA2Q719I0 299 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CAMKMTQ7Z624 323 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 IGFN1Q86VF2 1251 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NLRP8Q86W28 1048 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C11orf65Q8NCR3 313 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DOHHQ9BU89 302 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFAF4Q9P032 175 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PRKAB1Q9Y478 270 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PRAMEF25A6NGN4 478 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 LILRB5O75023 590 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 LCKP06239 509 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PCDH1Q08174 1060 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf53Q5VUE5 145 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ENTHD1Q8IYW4 607 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NXPE3Q969Y0 559 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 IL17FQ96PD4 163 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 FEVQ99581 238 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SLC35A5Q9BS91 424 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 REEP4Q9H6H4 257 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TRIM39Q9HCM9 518 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 AMBNQ9NP70 447 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PRDM8Q9NQV8 689 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 UNC80Q8N2C7 3258 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RGS10O43665 173 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 GABARAPO95166 117 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CISD3P0C7P0 127 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PCGF2P35227 344 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DGKGP49619 791 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SELENOWP63302 87 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SLCO6A1Q86UG4 719 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DNASE1L2Q92874 299 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 YIPF6Q96EC8 236 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DTD2Q96FN9 168 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ACOT13Q9NPJ3 140 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RAD18Q9NS91 495 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PLAGL1Q9UM63 463 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ERGIC3Q9Y282 383 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.69■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PIPSLA2A3N6 862 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CXCR4P61073 352 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NCS1P62166 190 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C2orf80Q0P641 193 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NDUFA5Q16718 116 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF547Q8IVP9 402 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NFKBIDQ8NI38 313 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 COQ10AQ96MF6 247 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ANTXRLA6NF34 631 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 KLK1P06870 262 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CEBPBP17676 345 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 IRS1P35568 1242 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TAS2R50P59544 299 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MVKQ03426 396 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TAP2Q03519 686 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 NFE2L1Q14494 772 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 RAET1GQ6H3X3 334 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SFTPA1Q8IWL2 248 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SLC5A8Q8N695 610 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 EPYCQ99645 322 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SPASTQ9UBP0 616 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa15.68■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CARNS1A5YM72 827 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 PRRT4C9JH25 899 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 J3KTA2 159 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 MMP20O60882 483 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TNFRSF21O75509 655 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 DNAJB5O75953 348 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CYP17A1P05093 508 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 FURINP09958 794 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 KCNC4Q03721 635 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 FPGSQ05932 587 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 TMEM236Q5W0B7 351 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 CLIP4Q8N3C7 705 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 C16orf78Q8WTQ4 265 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ZFYVE19Q96K21 471 aa15.67■□□□□ 0.1
SHQ1-201ENST00000325599 ACAT2Q9BWD1 397 aa15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.9 ms