RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318074.9

SYTL1-201, Transcript of synaptotagmin like 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYTL1, Length 1,900 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL1-201ENST00000318074 HERC3Q15034 1050 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 NDUFA9Q16795 377 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PRTGQ2VWP7 1150 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PIP4P1Q86T03 277 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GPR135Q8IZ08 494 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 NSL1Q96IY1 281 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TAGLN3Q9UI15 199 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 HYKKA2RU49 373 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 LRATO95237 230 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 MTTPP55157 894 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 KCNK10P57789 538 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TAS2R50P59544 299 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ACY1Q03154 408 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SLAMF1Q13291 335 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF793Q6ZN11 406 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SNX32Q86XE0 403 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 FUNDC1Q8IVP5 155 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 POU5F2Q8N7G0 328 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SLC45A3Q96JT2 553 aa18.35■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 A0A0A6YYD5 115 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 FAM234BA2RU67 622 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 C9JVG2 144 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 AGRPO00253 132 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 AKAP10O43572 662 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 B3GALT4O96024 378 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SMIM10L1P0DMW3 83 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 COX4I1P13073 169 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PRDX6P30041 224 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 NHLH1Q02575 133 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 BNIP1Q12981 228 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GARNL3Q5VVW2 1013 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GK5Q6ZS86 529 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 STARD8Q92502 1023 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SMIM10Q96HG1 83 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TMEM74Q96NL1 305 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SLC25A23Q9BV35 468 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ANKHQ9HCJ1 492 aa18.34■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 NR5A2O00482 541 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TMPRSS11DO60235 418 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PRMT3O60678 531 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 FAM58BPP0C7Q3 252 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 CD1EP15812 388 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 IL1RNP18510 177 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 CALB2P22676 271 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 CERS1P27544 350 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 GSTM5P46439 218 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 ITGA1P56199 1179 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 RCAN2Q14206 197 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 IKBIPQ70UQ0 350 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 AMER3Q8N944 861 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 SERINC2Q96SA4 455 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 MYNNQ9NPC7 610 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 MAPRE3Q9UPY8 281 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa18.33■□□□□ 0.53
SYTL1-201ENST00000318074 FITM1A5D6W6 292 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 B3GALT2O43825 422 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 GUCY1B2O75343 617 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 KLHL18O94889 574 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 SCELO95171 688 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 IL12AP29459 219 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 HPCAL1P37235 193 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 MNAT1P51948 309 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 LIMK1P53667 647 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 SKP1P63208 163 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 FOXM1Q08050 763 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 STX5Q13190 355 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 HEPACAMQ14CZ8 416 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 FAM214AQ32MH5 1076 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 TLDC1Q6P9B6 456 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 AGBL5Q8NDL9 886 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 OR1L3Q8NH93 324 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 OR6C1Q96RD1 312 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 CLMPQ9H6B4 373 aa18.33■□□□□ 0.52
SYTL1-201ENST00000318074 TXLNGQ9NUQ3 528 aa18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms