RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ADRB3P13945 408 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DDX5P17844 614 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NR4A1P22736 598 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KELP23276 732 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FSHRP23945 695 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MLLT10P55197 1068 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CYP2A13Q16696 494 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2UQ5VVX9 321 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 C12orf40Q86WS4 652 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF547Q8IVP9 402 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DEPDC4Q8N2C3 294 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OR4C15Q8NGM1 316 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MYDGFQ969H8 173 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FEVQ99581 238 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DYRK4Q9NR20 520 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 AASSQ9UDR5 926 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ANGPT4Q9Y264 503 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CLDN24A6NM45 220 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OCM2P0CE71 109 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MICAQ29983 383 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ARMC8Q8IUR7 673 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NFKBIDQ8NI38 313 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 APH1BQ8WW43 257 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TAMM41Q96BW9 452 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RNF6Q9Y252 685 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CORINQ9Y5Q5 1042 aa18.73■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OR2A25A4D2G3 310 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 J3QRK9 145 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SULT1C4O75897 302 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 GBAP04062 536 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ARAFP10398 606 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OPRL1P41146 370 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MC1RQ01726 317 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SPIBQ01892 262 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 GPR153Q6NV75 609 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PSD2Q9BQI7 771 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF556Q9HAH1 456 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MIEF1Q9NQG6 463 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ASF1AQ9Y294 204 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SAP18O00422 153 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MMP20O60882 483 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SEMA3DO95025 777 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TFPTP0C1Z6 253 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 UQCRC2P22695 453 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 HSD17B2P37059 387 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP19Q14CB8 494 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SLC5A12Q1EHB4 618 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MPEG1Q2M385 716 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 AHSA2Q719I0 299 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PDZD3Q86UT5 571 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DCUN1D3Q8IWE4 304 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CENPSQ8N2Z9 138 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 SLC5A8Q8N695 610 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KCNC2Q96PR1 638 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OR52A5Q9H2C5 316 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ANKHQ9HCJ1 492 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DEC1Q9P2X7 70 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RWDD3Q9Y3V2 267 aa18.72■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PRRT4C9JH25 899 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 MAN1A2O60476 641 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL18O94889 574 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NFATC1O95644 943 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 OPN1SWP03999 348 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RPN2P04844 631 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 CXCR2P25025 360 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 METAP1P53582 386 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NFE2L1Q14494 772 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RNF130Q86XS8 419 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 DENND6BQ8NEG7 585 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 RHOXF1Q8NHV9 184 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NXPE3Q969Y0 559 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PIP5K1AQ99755 562 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 COPS4Q9BT78 406 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 NLNQ9BYT8 704 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO8Q9NRD0 319 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
SPNS1-201ENST00000311008 IL3P08700 152 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS1-201ENST00000311008 SERPINB1P30740 379 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS1-201ENST00000311008 HMGA2P52926 109 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS1-201ENST00000311008 CDH12P55289 794 aa18.7■□□□□ 0.58
SPNS1-201ENST00000311008 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
SPNS1-201ENST00000311008 DGCR6Q14129 220 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms