RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 FAM83DQ9H4H8 585 aa14.72□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ENOPH1Q9UHY7 261 aa14.72□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa14.72□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TOXO94900 526 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 PRKCAP17252 672 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CSKP41240 450 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 XKP51811 444 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ZMYND11Q15326 602 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TEAD4Q15561 434 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 Q8N402 240 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SERHL2Q9H4I8 314 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SERHLQ9NQF3 203 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 IL17CQ9P0M4 197 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TRPS1Q9UHF7 1281 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 BCHEP06276 602 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 JUNDP17535 347 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 DDX5P17844 614 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 TGFBR2P37173 567 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ITGA1P56199 1179 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CDC20Q12834 499 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CNTN1Q12860 1018 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SMUG1Q53HV7 270 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 PEX5LQ8IYB4 626 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 OR6F1Q8NGZ6 308 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 ASB15Q8WXK1 588 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 MSANTD3Q96H12 275 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC29A3Q9BZD2 475 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SEC14L3Q9UDX4 400 aa14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
USP25-201ENST00000285679 SLC30A4O14863 429 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 SCO1O75880 301 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 HOXA9P31269 272 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 CLCN4P51793 760 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 FOXJ1Q92949 421 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 SLC39A13Q96H72 371 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 IL26Q9NPH9 171 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 NEU3Q9UQ49 428 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.71□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 GRXCR2A6NFK2 248 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 GLTPD2A6NH11 291 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 CELF2O95319 508 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 IGLV3-25P01717 112 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 HLA-EP13747 358 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 NSG1P42857 185 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 NRIP1P48552 1158 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 KCNC4Q03721 635 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 ANXA8L1Q5VT79 327 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 LHFPL3Q86UP9 236 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 TSSK6Q9BXA6 273 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MED28Q9H204 178 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 FNIP2Q9P278 1114 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 ANK1P16157 1881 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 LOC102723532A0A0G2JNH3 316 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 SDC2P34741 201 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 PREPP48147 710 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MC1RQ01726 317 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MAP2K5Q13163 448 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 E2F2Q14209 437 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 TATDN3Q17R31 274 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 PAQR6Q6TCH4 344 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 CBLL1Q75N03 491 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 KCTD7Q96MP8 289 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 RACGAP1Q9H0H5 632 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MCUBQ9NWR8 336 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF10BO14763 440 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 AKR7A2O43488 359 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 KDELR3O43731 214 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 SSNA1O43805 119 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 SLC28A2O43868 658 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 AOC2O75106 756 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 IGSF6O95976 241 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 AKR1A1P14550 325 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MAN2A2P49641 1150 aa14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
USP25-201ENST00000285679 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.9 ms