RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000251102.12

CNGB1-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel beta 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGB1, Length 5,641 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1-201ENST00000251102 PLATP00750 562 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 PRKACBP22694 351 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SP2Q02086 613 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GATAD2BQ8WXI9 593 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ABCG5Q9H222 651 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 IGFLR1Q9H665 355 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NANSQ9NR45 359 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 IFNA21P01568 189 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF20P17024 532 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 KDELR2P33947 212 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CD47Q08722 323 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ZFP90Q8TF47 636 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NXPE2Q96DL1 559 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 HSPA12BQ96MM6 686 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NLKQ9UBE8 527 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GRID2O43424 1007 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CLDN7O95471 211 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 AGR2O95994 175 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GRIK2Q13002 908 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CBFBQ13951 182 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TICAM1Q8IUC6 712 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 UBQLNLQ8IYU4 475 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 POGLUT1Q8NBL1 392 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TTLQ8NG68 377 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR6C4Q8NGE1 309 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TFAP2CQ92754 450 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TAPBPLQ9BX59 468 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 COQ3Q9NZJ6 369 aa14.95□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 BMP8BP34820 402 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CRISP1P54107 249 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 PON3Q15166 354 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 RHEBQ15382 184 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SLC36A3Q495N2 470 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ANKRD54Q6NXT1 300 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR4K1Q8NGD4 311 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FRS2Q8WU20 508 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TSGA13Q96PP4 275 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 KAT6AQ92794 2004 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FAAHO00519 579 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CAPN15O75808 1086 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NTRK2Q16620 822 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CARD16Q5EG05 197 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NOXRED1Q6NXP6 359 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR51B5Q9H339 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FBXL3Q9UKT7 428 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FAM72CH0Y354 149 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CDKN2DP55273 166 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FAM72AQ5TYM5 149 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FAM72DQ6L9T8 149 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 FAM72BQ86X60 149 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR8S1Q8NH09 359 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 NR4A3Q92570 626 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CCM2Q9BSQ5 444 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 MEN1O00255 615 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ATE1O95260 518 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GNRH1P01148 92 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 HSD17B2P37059 387 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 GK3PQ14409 553 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TAS1R3Q7RTX0 852 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 VWA5B2Q8N398 1253 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 PDYNP01213 254 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CLCN7P51798 805 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ABRAXAS2Q15018 415 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 JAGN1Q8N5M9 183 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ASB15Q8WXK1 588 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.94□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CXCL14O95715 111 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 VAMP2P63027 116 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 CD300LFQ8TDQ1 290 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 MRGPRX2Q96LB1 330 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SORT1Q99523 831 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SMOQ99835 787 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 ARL6Q9H0F7 186 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.93□□□□□ -0.02
CNGB1-201ENST00000251102 SH2B3Q9UQQ2 575 aa14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms