RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 AOC2O75106 756 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 XPAP23025 273 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 MYL9P24844 172 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 APEX1P27695 318 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 PTPN6P29350 595 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 CDH4P55283 916 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 CXCR4P61073 352 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 KCNJ10P78508 379 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 MGAT3Q09327 533 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 OR2G6Q5TZ20 316 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 CHAC2Q8WUX2 184 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 VPS29Q9UBQ0 182 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 CFL2Q9Y281 166 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 GPR52Q9Y2T5 361 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 CFAP20Q9Y6A4 193 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
CTDP1-201ENST00000075430 ANKDD1BA6NHY2 528 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MYL12BO14950 172 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CH25HO95992 272 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GASTP01350 101 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRPS2P11908 318 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SRCP12931 536 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GJA1P17302 382 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 AMD1P17707 334 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 UQCRC1P31930 480 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HMGCLP35914 325 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PLET1Q6UQ28 207 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OR5H6Q8NGV6 325 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TP53INP1Q96A56 240 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TBC1D17Q9HA65 648 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 FAM172BPA6NC97 362 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC38A8A6NNN8 435 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CLDN11O75508 207 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MBTPS1Q14703 1052 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BTBD16Q32M84 506 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 OR7G1Q8NGA0 311 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC22A12Q96S37 553 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35A5Q9BS91 424 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DOHHQ9BU89 302 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BARHL1Q9BZE3 327 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SPTBP11277 2137 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MYO9BQ13459 2157 aa16.08■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRAMEF10O60809 474 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 NME6O75414 186 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SERPIND1P05546 499 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRPS1L1P21108 318 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MAPK1P28482 360 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 IFNA8P32881 189 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CLCN4P51793 760 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ITGA1P56199 1179 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 E2F2Q14209 437 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CDK10Q15131 360 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 LACC1Q8IV20 430 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GREB1Q4ZG55 1949 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ARHGEF9O43307 516 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ACVR2AP27037 513 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 BDKRB1P46663 353 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 GALK2Q01415 458 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SCARB2Q14108 478 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RGNQ15493 299 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 SSX1Q16384 188 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ALG1LQ6GMV1 187 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRIM46Q7Z4K8 759 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF366Q8N895 744 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PEX13Q92968 403 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TADA1Q96BN2 335 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CCDC120Q96HB5 630 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 UCK2Q9BZX2 261 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TRBC2A0A5B9 178 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM202A6NGA9 273 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ICMTO60725 284 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 ADAMTS4O75173 837 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RFX2P48378 723 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 MAN2A2P49641 1150 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 PRKAG1P54619 331 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 RPS13P62277 151 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 HBA1P69905 142 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 DOC2AQ14183 400 aa16.07■□□□□ 0.16
CTDP1-201ENST00000075430 INSL4Q14641 139 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms