RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027817.7

Spta1-201, Transcript of Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Spta1, Length 8,406 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1-201ENSMUST00000027817 ClmpQ8R373 373 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Golga7Q91W53 137 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Fam96bQ9D187 163 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gm29106A0A087WSP8 697 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gm8973D3YX71 104 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r34E9PVI0 852 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Cyp2b23E9Q593 491 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r40F6W043 852 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r37F8VQD3 802 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r36K7N741 852 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Cxcr2P35343 359 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Rab8aP55258 207 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Rps3P62908 243 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Adra1bP97717 514 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 InhaQ04997 366 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Sox4Q06831 440 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Klra4Q60651 263 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 EdnraQ61614 427 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Lingo3Q6GQU6 589 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Slc39a10Q6P5F6 833 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ccdc36Q6PDM4 574 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Tas2r106Q7M724 308 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vtcn1Q7TSP5 283 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Hs3st5Q8BSL4 346 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Slco2b1Q8BXB6 683 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 D8Ertd738eQ8R1F0 94 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Tmem168Q91VX9 697 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 PnckQ9QYK9 343 aa6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 Bag6Q9Z1R2 1154 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
Spta1-201ENSMUST00000027817 A0A286YD17 136 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r48E9Q5D8 855 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Rab11fip2G3XA57 512 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r52L7N2B2 852 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Oaz2O08608 189 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Tbxas1P36423 533 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Rpl6P47911 296 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 IduaP48441 634 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ranbp9P69566 653 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Glycam1Q02596 151 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Fscn2Q32M02 492 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 HlxQ61670 476 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ifngr2Q63953 332 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Zc3h11aQ6NZF1 792 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Npas4Q8BGD7 802 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Agbl2Q8CDK2 862 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ccm2Q8K2Y9 453 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Hbp1Q8R316 516 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Cops8Q8VBV7 209 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ppa2Q91VM9 330 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Fndc8Q9D2H8 321 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Pus10Q9D3U0 527 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Cers5Q9D6K9 414 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ift43Q9DA69 206 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Dclk1Q9JLM8 756 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 NagaQ9QWR8 415 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Dnajb1Q9QYJ3 340 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 TsnaxQ9QZE7 290 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Padi3Q9Z184 664 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Olfr1022L7MTT3 315 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Sult2b1O35400 338 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gnao1P18872 354 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Dsg1cQ7TSF0 911 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Mcph1Q7TT79 822 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Aoc2Q812C9 757 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Acot4Q8BWN8 421 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 GlyatQ91XE0 296 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Uckl1Q91YL3 548 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Imp3Q921Y2 184 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 NepnQ9CQ76 512 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Fbxl20Q9CZV8 436 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 GraspQ9JJA9 392 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Elovl2Q9JLJ4 292 aa6.9□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Olfr675A0A1B0GSE1 317 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Zfp981A2A8V7 445 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 4930595D18RikD3Z642 64 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Vmn2r114E9Q281 856 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Chrm1P12657 460 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Eml1Q05BC3 814 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Ube2j2Q6P073 259 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Chpt1Q8C025 398 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Zmiz2Q8CIE2 920 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Pycr2Q922Q4 320 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Txndc17Q9CQM5 123 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Arv1Q9D0U9 266 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Dtwd1Q9D8U7 304 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gm266A6H634 200 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gm21904A8HG57 180 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Arl9F7BE40 171 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gm21866J3QMH4 180 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Rbbp9O88851 186 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Atp1b2P14231 290 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Hoxa10P31310 416 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Aff3P51827 1254 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Fmo5P97872 533 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Kcna7Q17ST2 489 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Cpa6Q5U901 438 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Olfr1308Q7TQX0 320 aa6.89□□□□□ -1.31
Spta1-201ENSMUST00000027817 Gpr61Q8C010 449 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.7 ms