RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mid1O70583 680 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp1P08042 402 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tgfb3P17125 410 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fezf1Q0VDQ9 475 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmc5Q32NZ6 967 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr318Q5NCD7 306 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nr1h4Q60641 488 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc25a23Q6GQS1 467 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chst2Q80WV3 530 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8BGK9 164 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Map4k5Q8BPM2 847 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fastkd3Q8BSN9 661 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rdh1Q8CGV4 317 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ing3Q8VEK6 421 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr854Q8VFF1 315 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ints11Q9CWS4 600 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Exosc7Q9D0M0 291 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Insm2Q9JMC2 493 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gdf2Q9WV56 428 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scgb2b17S4R2V3 82 aa18.96■□□□□ 0.63
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cacna1eQ61290 2272 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm5938A2AEN9 163 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Man1b1A2AJ15 658 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ap1arE9PYF7 298 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r12L7N217 831 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mtnd5P03921 607 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TrhrP21761 393 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ephx2P34914 554 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ube2e3P52483 207 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ezh1P70351 747 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rnf44Q3UHJ8 407 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr320Q7TRZ4 306 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Clic5Q8BXK9 251 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Piwil2Q8CDG1 971 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tnfaip8l1Q8K288 186 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il23rQ8K4B4 644 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fitm1Q91V79 292 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd209aQ91ZX1 238 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35a5Q921R7 437 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Klhl35Q9CZ49 574 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ribc2Q9D4Q1 309 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tex22Q9D9U4 189 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ifi30Q9ESY9 248 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajb9Q9QYI6 222 aa18.95■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pkd2l1A2A259 760 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp352A2AML7 551 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Chst13D3Z6E3 336 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Inpp5aE9QAS7 422 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ephb6O08644 1014 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ThrbP37242 461 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CtnsP57757 367 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pnliprp1Q5BKQ4 473 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ClpbQ60649 677 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sema4cQ64151 834 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpgs2Q66JT5 296 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapre3Q6PER3 281 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Znf423Q80TS5 1292 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gstm7Q80W21 218 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ugt2b35Q8BJL9 529 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TrhdeQ8K093 1025 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Noxo1Q8VCM2 349 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vps4aQ8VEJ9 437 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r69Q8VIC1 319 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mgme1Q9CXC3 338 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MrrfQ9D6S7 262 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zswim2Q9D9X6 631 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 IsxA1A546 240 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cytl1A1E5L0 139 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr76A6PWY4 622 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp934K7N6H3 473 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pole2O54956 527 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bard1O70445 765 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psmb9P28076 219 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc11a1P41251 548 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp2cbP62715 309 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ppp2caP63330 309 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zp1Q62005 623 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sh3gl3Q62421 347 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxo30Q8BJL1 746 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm9881Q8BR56 211 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdt1Q8R4E9 557 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acsl6Q91WC3 697 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc13a2Q9ES88 586 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Panx1Q9JIP4 426 aa18.94■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1006A2ALD2 312 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gabrr3B2RXA8 464 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rgs7O54829 469 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tcea3P23881 347 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc6a12P31651 614 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DhpsQ3TXU5 369 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1364Q5SZS9 314 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt72Q6IME9 520 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zmiz1Q6P1E1 1072 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hmbox1Q8BJA3 419 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Strip2Q8C9H6 844 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Polr1eQ8K202 482 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AassQ99K67 926 aa18.93■□□□□ 0.62
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kdelr2Q9CQM2 212 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms