RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641281.1

CCDC196-208, Transcript of coiled-coil domain containing 196, human

Gene CCDC196, Length 1,018 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC196-208	ENST00000641281	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	OR52N2	Q8NGI0	321 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	OR5AR1	Q8NGP9	310 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	LINC01560	Q8TB33	94 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	HSPH1	Q92598	858 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	SLCO2A1	Q92959	643 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	FATE1	Q969F0	183 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	SCYL1	Q96KG9	808 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	TSGA13	Q96PP4	275 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	NPAS2	Q99743	824 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	DEFB127	Q9H1M4	99 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	COG4	Q9H9E3	785 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	SMOX	Q9NWM0	555 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	POLG2	Q9UHN1	485 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		6.59	□□□□□ -1.35
CCDC196-208	ENST00000641281	NOTCH1	P46531	2555 aa		6.59	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	IGHV3-20	A0A0C4DH32	117 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281		A0A1W2PPR1	153 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	DVL2	O14641	736 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	NDC80	O14777	642 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	SGTA	O43765	313 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PEX1	O43933	1283 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	KDM1A	O60341	852 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	NDST3	O95803	873 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	FAM157C	P0CG43	387 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	RALB	P11234	206 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	SDHA	P31040	664 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MASP1	P48740	699 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	CYB561	P49447	251 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TAS2R50	P59544	299 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	RPA4	Q13156	261 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MAMLD1	Q13495	774 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	EXT1	Q16394	746 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	RTL6	Q6ICC9	239 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	M1AP	Q8TC57	530 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ZNF398	Q8TD17	642 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	SLC22A18	Q96BI1	424 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	SH3GL2	Q99962	352 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	NDST4	Q9H3R1	872 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TRABD	Q9H4I3	376 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	CDCP1	Q9H5V8	836 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	LRTM1	Q9HBL6	345 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	STAU2	Q9NUL3	570 aa	Known RBP eCLIP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PARVA	Q9NVD7	372 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	STOX2	Q9P2F5	926 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	C19orf25	Q9UFG5	118 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ASF1A	Q9Y294	204 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PKP3	Q9Y446	797 aa		6.58	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	HCFC1	P51610	2035 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	HSPB2	A8KAH6	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	QSOX1	O00391	747 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MFSD11	O43934	449 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	STATH	P02808	62 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ANXA5	P08758	320 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TPBGL	P0DKB5	382 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ERVK-10	P10266	1014 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	FPR1	P21462	350 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	BMP5	P22003	454 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	IL1R2	P27930	398 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PEBP1	P30086	187 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PRLHR	P49683	370 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	PKP1	Q13835	747 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	HSPB2	Q16082	182 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MAN2A1	Q16706	1144 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	RPS19BP1	Q86WX3	136 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	CNTD1	Q8N815	330 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	CCNY	Q8ND76	341 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CCDC196-208	ENST00000641281	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		6.57	□□□□□ -1.36

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