RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD13Q7L211 337 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS8Q9BT25 410 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ERVK-11Q9UQG0 969 aa25.55■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ1P48048 391 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 VPS41P49754 854 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF75DP51815 510 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PWP1Q13610 501 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MDGA2Q7Z553 956 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP21Q8N119 569 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDM9Q9NQV7 894 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 COMMD10Q9Y6G5 202 aa25.54■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM166BA8MTA8 275 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPA2E9PIF3 369 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 NPIPA3F8WFD2 350 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 ITGA10O75578 1167 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 C8GP07360 202 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HNF4AP41235 474 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RGS4P49798 205 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN2P51788 898 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXC2Q99958 501 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SGPP1Q9BX95 441 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC6A16Q9GZN6 736 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PARVBQ9HBI1 364 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 NECTIN3Q9NQS3 549 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PLSCR2Q9NRY7 297 aa25.53■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1DO94832 1006 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 TUBB4AP04350 444 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RNH1P13489 461 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK2P20151 261 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2ADP20671 130 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB8AP61006 207 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIAP62937 165 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1HQ8N1T3 1032 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5M9Q8NGP3 310 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 HIST1H2AJQ99878 128 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 H2AFJQ9BTM1 129 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 KCMF1Q9P0J7 381 aa25.52■■□□□ 1.68
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBC2A0A5B9 178 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM221AA4D161 298 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ACOT7O00154 380 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 KLK8O60259 260 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NPPBP16860 134 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SSR4P51571 173 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SP140Q13342 867 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 EMC4Q5J8M3 183 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 B3GNT7Q8NFL0 401 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PYCR2Q96C36 320 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC77Q9BR77 488 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA3Q9NST1 481 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NAV3Q8IVL0 2385 aa25.51■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 DRD2P14416 443 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CEBPEQ15744 281 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GXYLT1Q4G148 440 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC3Q5W041 872 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF585AQ6P3V2 769 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 APCDD1LQ8NCL9 501 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ABHD11Q8NFV4 315 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MYRIPQ8NFW9 859 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NT5CQ8TCD5 201 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CALML6Q8TD86 181 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NINJ1Q92982 152 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 SNF8Q96H20 258 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 NDNQ99608 321 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFATQ9P243 1243 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO5Q9UKT4 447 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 GUCA1BQ9UMX6 200 aa25.5■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 A8MVJ9 347 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 HAUS5O94927 633 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 ARMC10Q8N2F6 343 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 PSD4Q8NDX1 1056 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-217ENST00000629983 MAIP1Q8WWC4 291 aa25.49■■□□□ 1.67
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