RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM92BQ6ZTR7 304 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 IKBIPQ70UQ0 350 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OR4N4Q8N0Y3 316 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 KCT2Q8NC54 265 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM13CQ8NE31 585 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OR6C4Q8NGE1 309 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8J2Q8NGG1 315 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 NCSTNQ92542 709 aa23.7■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 CDRT15Q96T59 188 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CD180Q99467 661 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM60AQ9NP50 221 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ATP6V1HQ9UI12 483 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GMEB2Q9UKD1 530 aa23.7■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0A6YYD5 115 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ARHGAP10A1A4S6 786 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 GABRR3A8MPY1 467 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 H0YGG7 62 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 P2RX6O15547 441 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SH3BP5O60239 455 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PCDHGA12O60330 932 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 COX7A2P14406 83 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 SSR2P43308 183 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF793Q6ZN11 406 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 GPR180Q86V85 440 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 AMER3Q8N944 861 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 GTF2H4Q92759 462 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZDHHC12Q96GR4 267 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TGM7Q96PF1 710 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC39A3Q9BRY0 314 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 IL1RL2Q9HB29 575 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLAMF8Q9P0V8 285 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 R4GN57 208 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 U3KQA8 63 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0G2JN53 185 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 MTTPP55157 894 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf80Q0P641 193 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PDE7AQ13946 482 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DLEU7Q6UYE1 221 aa23.69■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 TCTN2Q96GX1 697 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SMOC1Q9H4F8 434 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC7A8Q9UHI5 535 aa23.69■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 IL3P08700 152 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 FURINP09958 794 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM10L1P0DMW3 83 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 ENGP17813 658 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 PRMT9Q6P2P2 845 aa23.68■■□□□ 1.38
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CAPNS1-215ENST00000628018 FBXW8Q8N3Y1 598 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJC22Q8N4W6 341 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 EFCAB3Q8N7B9 438 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC74AQ96AQ1 378 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 MTERF3Q96E29 417 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SMIM10Q96HG1 83 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SPAG4Q9NPE6 437 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 SERHLQ9NQF3 203 aa23.68■■□□□ 1.38
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM181Q9P2C4 612 aa23.68■■□□□ 1.38
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