RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613995.4

PDE4DIP-240, Transcript of phosphodiesterase 4D interacting protein, human

TSL 5

Gene PDE4DIP, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CD1D	P15813	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NPPB	P16860	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AGXT	P21549	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CRABP2	P29373	138 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MSH2	P43246	934 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GABRA4	P48169	554 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PMS2	P54278	862 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ABAT	P80404	500 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NFKB2	Q00653	900 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	IRF9	Q00978	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PRDX1	Q06830	199 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ERV3-1	Q14264	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	GRM7	Q14831	915 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NAA25	Q14CX7	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR4D1	Q15615	310 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZXDC	Q2QGD7	858 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TCTE1	Q5JU00	501 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FAM69B	Q5VUD6	431 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MLIP	Q5VWP3	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FRMPD2B	Q6IN97	320 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OGFOD2	Q6N063	350 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TLDC1	Q6P9B6	456 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RNF44	Q7L0R7	432 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	LILRA2	Q8N149	483 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	OR56A3	Q8NH54	315 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ATL1	Q8WXF7	558 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	STARD8	Q92502	1023 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EXTL1	Q92935	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PTER	Q96BW5	349 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FBXL8	Q96CD0	374 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CABS1	Q96KC9	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RUFY1	Q96T51	708 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZFYVE21	Q9BQ24	234 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HAUS8	Q9BT25	410 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DERL2	Q9GZP9	239 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CHRNA10	Q9GZZ6	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	VPS11	Q9H270	941 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ACTL8	Q9H568	366 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ALG9	Q9H6U8	611 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	POPDC3	Q9HBV1	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SNX15	Q9NRS6	342 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	WWOX	Q9NZC7	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CD274	Q9NZQ7	290 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DHCR7	Q9UBM7	475 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TLK1	Q9UKI8	766 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SNX7	Q9UNH6	387 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ACOT9	Q9Y305	439 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	AP1M2	Q9Y6Q5	423 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	CENPE	Q02224	2701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995		A0A087X1B8	175 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995		A0A096LPK6	155 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SMIM23	A6NLE4	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	C21orf140	B9A014	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995		H3BMH7	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	HAT1	O14929	419 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	DSCR3	O14972	297 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	P2RX6	O15547	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDE4DIP-240	ENST00000613995	RIPK2	O43353	540 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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