RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 HSDL2Q6YN16 418 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 USP43Q70EL4 1123 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FZD3Q9NPG1 666 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC37A3O60309 1634 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 NALCNQ8IZF0 1738 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 UQCRC2P22695 453 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 OR4D2P58180 307 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ABHD18Q0P651 414 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM5Q9Y2B1 443 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CLRN1P58418 232 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RPS15P62841 145 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF550Q7Z398 422 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PEX13Q92968 403 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PYURFQ96I23 114 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TRIB3Q96RU7 358 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 OARD1Q9Y530 152 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RORCP51449 518 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 HTRA3P83110 453 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM17Q86X19 198 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 HSH2DQ96JZ2 352 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 MRGPRX2Q96LB1 330 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRA2Q9H9E1 313 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PLCL2Q9UPR0 1127 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 MAPKAP1Q9BPZ7 522 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RMI1Q9H9A7 625 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CXorf21Q9HAI6 301 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RARRES3Q9UL19 164 aa19.48■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 AQP4P55087 323 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PLP2Q04941 152 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 C1orf94Q6P1W5 598 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FRMD7Q6ZUT3 714 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 STX12Q86Y82 276 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FAM86B1Q8N7N1 296 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ASB6Q9NWX5 421 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 NLGN3Q9NZ94 848 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FARS2O95363 451 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TIGD6Q17RP2 521 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC36Q8IYA8 594 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC116Q8IYX3 515 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 AQP11Q8NBQ7 271 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 A0A1W2PP18 115 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 MID1O15344 667 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 IFI30P13284 250 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 AGTR2P50052 363 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 IRF5Q13568 498 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CSNK1A1LQ8N752 337 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 OR4C15Q8NGM1 316 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 SIGLEC10Q96LC7 697 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 COMMD3Q9UBI1 195 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ZNF639Q9UID6 485 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CH25HO95992 272 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PIGWQ7Z7B1 504 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 GPAT4Q86UL3 456 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PLXDC1Q8IUK5 500 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 APCDD1Q8J025 514 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 IFT52Q9Y366 437 aa19.47■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RABIFP47224 123 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 DNAJB13P59910 316 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMEM225Q6GV28 225 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 REEP3Q6NUK4 255 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 EPGNQ6UW88 154 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RNF111Q6ZNA4 994 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ALPK1Q96QP1 1244 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TAS2R1Q9NYW7 299 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FABP12A6NFH5 140 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 GSK3BP49841 420 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 GSTM4Q03013 218 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PLCXD2Q0VAA5 305 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TMBIM1Q969X1 311 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 TM9SF2Q99805 663 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 AMBNQ9NP70 447 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 GLS2Q9UI32 602 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 CREG1O75629 220 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 MERTKQ12866 999 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 FAM189A2Q15884 450 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 EMC10Q5UCC4 262 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 USP53Q70EK8 1073 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP19.46■□□□□ 0.714e-6■■■■□ 20.6
CTDP1-208ENST00000613122 MEMO1Q9Y316 297 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 GABRA3P34903 492 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 PUDPQ08623 228 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA0319Q5VV43 1072 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 SLC17A9Q9BYT1 436 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 E7EQ34 232 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 HCRTR2O43614 444 aa19.46■□□□□ 0.71
CTDP1-208ENST00000613122 ITGA5P08648 1049 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms