RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590061.1

SMAD4-210, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 544 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-210ENST00000590061 RGMAQ96B86 450 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KCNC2Q96PR1 638 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 OR2A14Q96R47 310 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 OR4K3Q96R72 315 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 DPH7Q9BTV6 452 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 NUF2Q9BZD4 464 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ATAD3AQ9NVI7 634 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PNPOQ9NVS9 261 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 MS4A12Q9NXJ0 267 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CDC14AQ9UNH5 594 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 AP3M1Q9Y2T2 418 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 RNF11Q9Y3C5 154 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 FAM186AA6NE01 2351 aa7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 OR2A25A4D2G3 310 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 H7BY64 318 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PIP5K1BO14986 540 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SIGLEC6O43699 453 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SDC3O75056 442 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SEC22BO75396 215 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 EML2O95834 649 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 NPPAP01160 153 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KRT16P08779 473 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CD63P08962 238 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PCNAP12004 261 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 DRD2P14416 443 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 POLR2CP19387 275 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PRPS1L1P21108 318 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 IL10P22301 178 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ACP1P24666 158 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ALDH4A1P30038 563 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PRDX6P30041 224 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 GRIA3P42263 894 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 RAP1GDS1P52306 607 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 LIMK1P53667 647 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CSNK1G2P78368 415 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ACY1Q03154 408 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 BTKQ06187 659 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 BNIP3Q12983 259 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 BIKQ13323 160 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KRT72Q14CN4 511 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 HERC3Q15034 1050 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 AP5B1Q2VPB7 878 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 XKR7Q5GH72 579 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 DEPDC1Q5TB30 811 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ZNF425Q6IV72 752 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 IRGCQ6NXR0 463 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM71Q6P5X7 295 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 GALNT18Q6P9A2 607 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TLDC1Q6P9B6 456 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TRIM40Q6P9F5 258 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SUSD1Q6UWL2 747 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CCDC121Q6ZUS5 278 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SPRED1Q7Z699 444 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ZFAND4Q86XD8 727 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SLC35F3Q8IY50 421 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 GPR135Q8IZ08 494 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 EID2Q8N6I1 236 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 LINC01555Q8NAE3 123 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 FNDC5Q8NAU1 212 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 KYQ8NBH2 561 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 SUMF1Q8NBK3 374 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 OR4D9Q8NGE8 314 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 HUS1BQ8NHY5 278 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 NCSTNQ92542 709 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 MTERF3Q96E29 417 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 MVB12AQ96EY5 273 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 APOLD1Q96LR9 279 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 DMRTB1Q96MA1 342 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 FRMD6Q96NE9 622 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TMEM74Q96NL1 305 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 PRAP1Q96NZ9 151 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 IL17FQ96PD4 163 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 FCRL4Q96PJ5 515 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 TBCDQ9BTW9 1192 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 ACAT2Q9BWD1 397 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 FAIM2Q9BWQ8 316 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 STRADBQ9C0K7 418 aa7□□□□□ -1.29
SMAD4-210ENST00000590061 XKR8Q9H6D3 395 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.5 ms