RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	KCNN4	O15554	427 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TTI1	O43156	1089 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RGS14	O43566	566 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SPRY3	O43610	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KDELR3	O43731	214 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ITM2A	O43736	263 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KLK8	O60259	260 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SNAP91	O60641	907 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CD160	O95971	181 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	IFNB1	P01574	187 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	KRT14	P02533	472 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TF	P02787	698 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RHOC	P08134	193 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RHOXF2B	P0C7M4	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCNB1	P14635	433 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ITGAX	P20702	1163 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCNC	P24863	283 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PTPN3	P26045	913 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RPL22	P35268	128 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	OPRD1	P41143	372 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NDST2	P52849	883 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PLK1	P53350	603 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARF5	P84085	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DR1	Q01658	176 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLC10A7	Q0GE19	358 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	AP1B1	Q10567	949 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CDH18	Q13634	790 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	IHH	Q14623	411 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PDGFRL	Q15198	375 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CYTH1	Q15438	398 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GSTA3	Q16772	222 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RABGAP1L	Q5R372	815 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TEX35	Q5T0J7	233 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TRIL	Q7L0X0	811 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	BZW1	Q7L1Q6	419 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PID1	Q7Z2X4	250 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TECPR1	Q7Z6L1	1165 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF567	Q8N184	647 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO2A1	Q92959	643 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HDAC11	Q96DB2	347 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PERP	Q96FX8	193 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	H2AFJ	Q9BTM1	129 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SLCO3A1	Q9UIG8	710 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SNX24	Q9Y343	169 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MYO10	Q9HD67	2058 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	C5orf60	A6NFR6	353 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SHISA7	A6NL88	538 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	HACD1	B0YJ81	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934		K7ERQ8	282 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SEC14L5	O43304	696 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SMAD6	O43541	496 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	CACNG3	O60359	315 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF11	O60813	436 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	GJB3	O75712	270 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TMEM63A	O94886	807 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM40	O96008	361 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	ETFA	P13804	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	NAGA	P17050	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	SERPINB6	P35237	376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	PIGA	P37287	484 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RFX2	P48378	723 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	FNTA	P49354	379 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	TERF1	P54274	439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	MAX	P61244	160 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LINS1-210	ENST00000560934	RPS3A	P61247	264 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71

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