RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RSC1A1	Q92681	617 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	INPP5D	Q92835	1189 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MRGPRX4	Q96LA9	322 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C9orf72	Q96LT7	481 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OR6C1	Q96RD1	312 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TAAR9	Q96RI9	348 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NDN	Q99608	321 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NRTN	Q99748	197 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP3K3	Q99759	626 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NAT9	Q9BTE0	207 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MVB12B	Q9H7P6	319 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	POT1	Q9NUX5	634 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	GALP	Q9UBC7	116 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	POLG2	Q9UHN1	485 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC24A2	Q9UI40	661 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RUVBL2	Q9Y230	463 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	BPTF	Q12830	3046 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TPR	P12270	2363 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.49	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MED13	Q9UHV7	2174 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PIPSL	A2A3N6	862 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288		A6NCN8	305 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TMEM8B	A6NDV4	472 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	C2orf74	A8MZ97	194 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	NPIPB8	E9PQR5	432 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288		H3BMM5	538 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TAF4	O00268	1085 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZBTB14	O43829	449 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TTC4	O95801	387 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	AHSG	P02765	367 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RPN2	P04844	631 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FGF3	P11487	239 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PVR	P15151	417 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	OGN	P20774	298 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MAL	P21145	153 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ITPKB	P27987	946 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MAGEA4	P43358	317 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	BDKRB1	P46663	353 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CD151	P48509	253 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PGGT1B	P53609	377 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PPP1CA	P62136	330 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PLOD1	Q02809	727 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CAV1	Q03135	178 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TLE1	Q04724	770 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ACVR1	Q04771	509 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	RPA4	Q13156	261 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KCNAB1	Q14722	419 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CRYM	Q14894	314 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TGIF1	Q15583	401 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	KLHL38	Q2WGJ6	581 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PGS1	Q32NB8	556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TTLL9	Q3SXZ7	439 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSBG2	Q5FVE4	666 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CTSL3P	Q5NE16	218 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PLEKHS1	Q5SXH7	462 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	DUPD1	Q68J44	220 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR74	Q6RFH5	385 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.48	□□□□□ -1.69
ATXN3-238	ENST00000556288	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69

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