RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551920.1

GCN1-209, Transcript of GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog, humanhuman

TSL 3

Gene GCN1, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCN1-209ENST00000551920 ARMC2Q8NEN0 867 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR4F6Q8NGB9 312 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RDH11Q8TC12 318 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MIEF2Q96C03 454 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 QRFPRQ96P65 431 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 F2RL3Q96RI0 385 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RBCK1Q9BYM8 510 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TGIF2Q9GZN2 237 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 KALRNO60229 2985 aa15.48■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TYROBPO43914 113 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SH3BGRLO75368 114 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SUPT7LO94864 414 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 BMP10O95393 424 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ETHE1O95571 254 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CCR10P46092 362 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 XCR1P46094 333 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 NEK2P51955 445 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 PLA2G16P53816 162 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RHDQ02161 417 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OCA2Q04671 838 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RBBP7Q16576 425 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR2L5Q8NG80 312 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 UBE2E3Q969T4 207 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CATSPER2Q96P56 530 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 FAM111AQ96PZ2 611 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF382Q96SR6 550 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CRB3Q9BUF7 120 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR51B5Q9H339 312 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 POLHQ9Y253 713 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 KCNMB2Q9Y691 235 aa15.47■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OR2W5A6NFC9 320 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 IDSB3KWA1 339 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MASP2O00187 686 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SAP18O00422 153 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SOCS6O14544 535 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OTCP00480 354 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TGFB1P01137 390 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CD63P08962 238 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CPA3P15088 417 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MMP11P24347 488 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SERPINB1P30740 379 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 PIK3CBP42338 1070 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 BTN3A2P78410 334 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CHAF1BQ13112 559 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SSPNQ14714 243 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 BORAQ6PGQ7 559 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ZNF793Q6ZN11 406 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 C10orf107Q8IVU9 208 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 CCDC63Q8NA47 563 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TCP10LQ8TDR4 215 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 THAP4Q8WY91 577 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 PGM2Q96G03 612 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 PEX11GQ96HA9 241 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 SMC6Q96SB8 1091 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MECRQ9BV79 373 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 VN1R1Q9GZP7 353 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 LANCL2Q9NS86 450 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 OXSMQ9NWU1 459 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 C3orf18Q9UK00 162 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.46■□□□□ 0.07
GCN1-209ENST00000551920 ATRXP46100 2492 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 URADA6NGE7 173 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 ERVH48-1M5A8F1 160 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 CHST10O43529 356 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 DNAJB5O75953 348 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 OR4F21O95013 312 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 FAM87AP0C7U9 286 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 CERS1P27544 350 aa15.45■□□□□ 0.06
GCN1-209ENST00000551920 NAGLUP54802 743 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms