RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RAB33BQ9H082 229 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DPEP2Q9H4A9 486 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HAUS4Q9H6D7 363 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 EBF2Q9HAK2 575 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FANCEQ9HB96 536 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MAGEE1Q9HCI5 957 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 WASH6PQ9NQA3 447 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO8Q9NRD0 319 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LHX3Q9UBR4 397 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ANAPC7Q9UJX3 599 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 NFU1Q9UMS0 254 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ASPMQ8IZT6 3477 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SPTA1P02549 2419 aa4.1□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MYLKQ15746 1914 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0J9YYE9 177 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 C21orf140B9A014 251 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 H7C1Q1 480 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 K7ERQ8 282 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PFDN6O15212 129 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SDC3O75056 442 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ANXA9O76027 345 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PROSCO94903 275 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TNFSF15O95150 251 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GAS8O95995 478 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TRBC1P01850 177 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HBQ1P09105 142 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 F3P13726 295 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CHRNB2P17787 502 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DPA1P20036 260 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TGM2P21980 687 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GRK5P34947 590 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 UGT1A5P35504 534 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HADHAP40939 763 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LIMK2P53671 638 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HADHBP55084 474 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN2P57739 230 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CDK3Q00526 305 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ACY1Q03154 408 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DNAJC3Q13217 504 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 XRCC4Q13426 336 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CDKN3Q16667 212 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ALG11Q2TAA5 492 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB133Q30KQ1 61 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LDLRAP1Q5SW96 308 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GUSBP11Q6P575 273 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 C4orf22Q6V702 233 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SLC29A4Q7RTT9 530 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC13Q8IYE1 715 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC170Q8IYT3 715 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TRAM1L1Q8N609 369 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 OR52K2Q8NGK3 314 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 JOSD2Q8TAC2 188 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF398Q8TD17 642 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SLC20A1Q8WUM9 679 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CPT1BQ92523 772 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PEX13Q92968 403 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ULK4Q96C45 1275 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FAF2Q96CS3 445 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 AP2M1Q96CW1 435 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC42Q96M95 316 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CCM2Q9BSQ5 444 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SYT11Q9BT88 431 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 MLPHQ9BV36 600 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TM2D2Q9BX73 214 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 EPB41L5Q9HCM4 733 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PDE7BQ9NP56 450 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ACP6Q9NPH0 428 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 RASSF1Q9NS23 344 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SMOXQ9NWM0 555 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 EPHA6Q9UF33 1036 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 SATB2Q9UPW6 733 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 PKP3Q9Y446 797 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 LOXL2Q9Y4K0 774 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa4.09□□□□□ -1.75
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.09□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 LRP4O75096 1905 aa4.09□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa4.08□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 C5orf60A6NFR6 353 aa4.08□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 NPIPB13A6NJU9 1138 aa4.08□□□□□ -1.76
HDAC2-216ENST00000523628 C2orf81A6NN90 581 aa4.08□□□□□ -1.76
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