RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF248	Q8NDW4	579 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	IRF7	Q92985	503 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BIRC8	Q96P09	236 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC30A2	Q9BRI3	323 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PDCD10	Q9BUL8	212 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMED9	Q9BVK6	235 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ASPN	Q9BXN1	380 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	USP22	Q9UPT9	525 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	USP3	Q9Y6I4	520 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35F4	A4IF30	521 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PRMT3	O60678	531 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ADH5	P11766	374 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ALAS2	P22557	587 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SMS	P52788	366 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PTPRR	Q15256	657 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LIPJ	Q5W064	366 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MOSPD2	Q8NHP6	518 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	WFIKKN2	Q8TEU8	576 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HERVK_113	Q902F9	699 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MGLL	Q99685	303 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	COMMD9	Q9P000	198 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	7.77	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193		H3BMQ9	156 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FGF18	O76093	207 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	IL3	P08700	152 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	JUP	P14923	745 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CD72	P21854	359 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC5A2	P31639	672 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CD70	P32970	193 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BMX	P51813	675 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CDH11	P55287	796 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SP140	Q13342	867 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GINS1	Q14691	196 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC35F1	Q5T1Q4	408 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HSDL2	Q6YN16	418 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	FAM43B	Q6ZT52	329 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC30A8	Q8IWU4	369 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	COG8	Q96MW5	612 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC22A4	Q9H015	551 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MMP27	Q9H306	513 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	XKR8	Q9H6D3	395 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZDHHC4	Q9NPG8	344 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPRC5B	Q9NZH0	403 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	DUXA	A6NLW8	204 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HMGN1	P05114	100 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	LCK	P06239	509 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	C1GALT1C1L	P0DN25	315 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC6A4	P31645	630 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	KCNC1	P48547	511 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MLLT10	P55197	1068 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ANKDD1A	Q495B1	522 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CARM1	Q86X55	608 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	EGLN2	Q96KS0	407 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	MTG2	Q9H4K7	406 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ELAC1	Q9H777	363 aa	Known RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	COL18A1	P39060	1754 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GSTM2	P28161	218 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	BTN3A2	P78410	334 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TOMM20	Q15388	145 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	WSCD2	Q2TBF2	565 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	SLC36A3	Q495N2	470 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	HIST2H2AB	Q8IUE6	130 aa	Predicted RBP	7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CCDC116	Q8IYX3	515 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	CHST14	Q8NCH0	376 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	GPR150	Q8NGU9	434 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		7.76	□□□□□ -1.17
NEK1-208	ENST00000512193	PIGK	Q92643	395 aa		7.76	□□□□□ -1.17

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