RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490437.5

SRI-210, Transcript of sorcin, human

TSL 2 BASIC

Gene SRI, Length 570 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SRI-210	ENST00000490437	SPDEF	O95238	335 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MLYCD	O95822	493 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	EIF2S1	P05198	315 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PDHA1	P08559	390 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ANXA5	P08758	320 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CD48	P09326	243 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	EBLN1	P0CF75	366 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	POLR2C	P19387	275 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NR1D1	P20393	614 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	IL10	P22301	178 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GNLY	P22749	145 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	IL4R	P24394	825 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CXCR2	P25025	360 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	IL1R2	P27930	398 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTPN4	P29074	926 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTPN7	P35236	360 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HADHA	P40939	763 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HNF4A	P41235	474 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PRKCI	P41743	596 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CD151	P48509	253 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NR2C2	P49116	596 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CHN2	P52757	468 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTTG1IP	P53801	180 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PMS2	P54278	862 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NR1H2	P55055	460 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TUBB4B	P68371	445 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PRAME	P78395	509 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ARG2	P78540	354 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GBE1	Q04446	702 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OCA2	Q04671	838 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RBPJ	Q06330	500 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GALNT1	Q10472	559 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTP4A2	Q12974	167 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MPP3	Q13368	585 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	LAMB3	Q13751	1172 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TUBB2A	Q13885	445 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	DAG1	Q14118	895 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	DPYSL3	Q14195	570 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GPR18	Q14330	331 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	KCNAB1	Q14722	419 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SLMAP	Q14BN4	828 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RASA2	Q15283	850 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RBBP7	Q16576	425 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PFKFB4	Q16877	469 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MPEG1	Q2M385	716 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	C1orf189	Q5VU69	101 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PTRHD1	Q6GMV3	140 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RPUSD3	Q6P087	351 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SARM1	Q6SZW1	724 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	UNC5D	Q6UXZ4	953 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	GSTA5	Q7RTV2	222 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	TMPRSS9	Q7Z410	1059 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	BNIPL	Q7Z465	357 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ADCK2	Q7Z695	626 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CCDC91	Q7Z6B0	441 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	LUZP1	Q86V48	1076 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	KMT5C	Q86Y97	462 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CNGA4	Q8IV77	575 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	LNX2	Q8N448	690 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	UBL4B	Q8N7F7	174 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RNF152	Q8N8N0	203 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ENDOV	Q8N8Q3	282 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OR8K1	Q8NGG5	319 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	OR8K5	Q8NH50	307 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	FBXO30	Q8TB52	745 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HM13	Q8TCT9	377 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZNF398	Q8TD17	642 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CT55	Q8WUE5	264 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	PIH1D2	Q8WWB5	315 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ELMO1	Q92556	727 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	RSC1A1	Q92681	617 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	CAVIN3	Q969G5	261 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	ZBTB9	Q96C00	473 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	HDAC11	Q96DB2	347 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	IP6K3	Q96PC2	410 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	VAT1	Q99536	393 aa		2.55	□□□□□ -2
SRI-210	ENST00000490437	COPS8	Q99627	209 aa		2.55	□□□□□ -2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms