RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480273.5

RTEL1-TNFRSF6B-201, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 2

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 5,751 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MGAT4BQ9UQ53 548 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRNA1P02708 482 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HSD11B1P28845 292 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAGEA8P43361 318 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RFT1Q96AA3 541 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD180Q99467 661 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EXTL2Q9UBQ6 330 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 UBQLN2Q9UHD9 624 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MATN1P21941 496 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SCML4Q8N228 414 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PSKH2Q96QS6 385 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPN2P17706 415 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FNTBP49356 437 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PON3Q15166 354 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MSANTD3Q96H12 275 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF696Q9H7X3 374 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GKN1Q9NS71 199 aa16.6■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PRSS51A0A1B0GVH4 220 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 IL7P13232 177 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TAS2R43P59537 309 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTCHD3Q3KNS1 767 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DHRS1Q96LJ7 313 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CCSER2Q9H7U1 834 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ANKRD66B4E2M5 251 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SDHDO14521 159 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 VNN2O95498 520 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HPRP00739 348 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 MT-ND5P03915 603 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM168Q9H0V1 697 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GABRQQ9UN88 632 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RHPN2P1A8MT19 583 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CKMT1AP12532 417 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACP5P13686 325 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GXYLT1Q4G148 440 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PIGGQ5H8A4 983 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GARNL3Q5VVW2 1013 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF527Q8NB42 609 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SMPDL3BQ92485 455 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ACDQ96AP0 544 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DISC1C4P0D8 188 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 H7C2Y5 167 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HCRTO43612 131 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PCDHGA12O60330 932 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NPR2P20594 1047 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTGR1Q14914 329 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CHRDL2Q6WN34 429 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR8J3Q8NGG0 315 aa16.59■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HOXD13P35453 343 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GRIA2P42262 883 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CD97P48960 835 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 GNG2P59768 71 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 POGLUT1Q8NBL1 392 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR8S1Q8NH09 359 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PROM1O43490 865 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HTR1AP08908 422 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LSAMPQ13449 338 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PTPRCAPQ14761 206 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 ADGRF1Q5T601 910 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM53Q6P2H8 277 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC38A3Q99624 504 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OR51B5Q9H339 312 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 FBXL3Q9UKT7 428 aa16.58■□□□□ 0.25
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 DENRO43583 198 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SRCP12931 536 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC6A9P48067 706 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 E2F1Q01094 437 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 LIPKQ5VXJ0 399 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 CLDN19Q8N6F1 224 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SLC45A3Q96JT2 553 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TTTY10Q9BZA0 68 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SOCS2O14508 198 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 SAMD12Q8N8I0 201 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 HERVK_113Q902F9 699 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 OSTF1Q92882 214 aa16.58■□□□□ 0.24
RTEL1-TNFRSF6B-201ENST00000480273 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms