RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447402.7

SELENBP1-208, Transcript of selenium binding protein 1, human

TSL 2 BASIC

Gene SELENBP1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNUPN	O95149	360 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ETHE1	O95571	254 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DLGAP3	O95886	979 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LINC00032	P0C843	101 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIT	P10721	976 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RORA	P35398	523 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GCGR	P47871	477 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	BTK	Q06187	659 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPDYA	Q5MJ70	313 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGAP40	Q5TG30	622 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KANK2	Q63ZY3	851 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CACNA2D3	Q8IZS8	1091 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ESX1	Q8N693	406 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TWIST2	Q8WVJ9	160 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CKAP2	Q8WWK9	683 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GATA6	Q92908	595 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	FGF11	Q92914	225 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RGMA	Q96B86	450 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAGEB18	Q96M61	343 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LRFN5	Q96NI6	719 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GBP5	Q96PP8	586 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KCNC2	Q96PR1	638 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SORT1	Q99523	831 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SPRY4	Q9C004	299 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	BRF2	Q9HAW0	419 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LHX9	Q9NQ69	397 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PNPO	Q9NVS9	261 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PTGDR2	Q9Y5Y4	395 aa		13	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402		A0A088AWK7	358 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C4orf51	C9J302	202 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NSA2	O95478	260 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIM1	P11309	404 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TCN2	P20062	427 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SSR2	P43308	183 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PCBP4	P57723	403 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SKP1	P63208	163 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HMGCS1	Q01581	520 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GUCY1A3	Q02108	690 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CSTF3	Q12996	717 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CUL3	Q13618	768 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TGIF1	Q15583	401 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	AP5B1	Q2VPB7	878 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKAIN1	Q4KMZ8	207 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LCN10	Q6JVE6	187 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MVB12A	Q96EY5	273 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SORBS1	Q9BX66	1292 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MRPL1	Q9BYD6	325 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ACPT	Q9BZG2	426 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CHST8	Q9H2A9	424 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	AHSP	Q9NZD4	102 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	GPN3	Q9UHW5	284 aa	Predicted RBP	12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	AKAP13	Q12802	2813 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		12.99	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402		C9J4A7	227 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PLPP1	O14494	284 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PIP5K1B	O14986	540 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	RDH16	O75452	317 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	C1QTNF9	P0C862	333 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	LIPC	P11150	499 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD3B1	P14060	373 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HSD3B2	P26439	372 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OLR1	P78380	273 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OCRL	Q01968	901 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	ZNF33B	Q06732	778 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SYT16	Q17RD7	645 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	OR4C11	Q6IEV9	310 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	NKD1	Q969G9	470 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SMIM10	Q96HG1	83 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	SLCO1B3	Q9NPD5	702 aa		12.98	□□□□□ -0.33
SELENBP1-208	ENST00000447402	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		12.98	□□□□□ -0.33

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