RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.35■□□□□ 0.05
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SHQ1-202ENST00000444040 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
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SHQ1-202ENST00000444040 KLK1P06870 262 aa15.33■□□□□ 0.04
SHQ1-202ENST00000444040 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP15.33■□□□□ 0.04
SHQ1-202ENST00000444040 VBP1P61758 197 aa15.33■□□□□ 0.04
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