RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 H7BY64 318 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 DSCR3O14972 297 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 GUCA1CO95843 209 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SHBGP04278 402 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACPPP15309 386 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRABP2P29373 138 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC26A3P40879 764 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 MAGEA12P43365 314 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC6A12P48065 614 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATP6V0D1P61421 351 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 OCA2Q04671 838 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRM7Q14831 915 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TGFBIQ15582 683 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR4D1Q15615 310 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 INAQ16352 499 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 NKG7Q16617 165 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TTMPQ5BVD1 217 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 RPTNQ6XPR3 784 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 OVCH1Q7RTY7 1134 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 VN1R4Q7Z5H5 301 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 C17orf64Q86WR6 236 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLD3Q8IV08 490 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CATSPER1Q8NEC5 780 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SUN3Q8TAQ9 357 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 NR4A3Q92570 626 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 RELTQ969Z4 430 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1191Q96A73 305 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 RHBDF1Q96CC6 855 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CCDC120Q96HB5 630 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 C10orf90Q96M02 699 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRAP1Q96NZ9 151 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 HAUS8Q9BT25 410 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF160Q9HCG1 818 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRDM9Q9NQV7 894 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CUTCQ9NTM9 273 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ADAM21Q9UKJ8 722 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 IKBKGQ9Y6K9 419 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PKDREJQ9NTG1 2253 aa10.27□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 APCP25054 2843 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV17A0A0B4J275 112 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAPBPO15533 448 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 P2RX6O15547 441 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH16O75309 829 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 UNC5CO95185 931 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 HPP00738 406 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ANXA5P08758 320 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDH1P12830 882 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 GCAP28676 217 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 GGT5P36269 586 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLCO1A2P46721 670 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNC1P48547 511 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 HNMTP50135 292 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 BMPR2Q13873 1038 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CSHL1Q14406 222 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 HKDC1Q2TB90 917 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CDKL4Q5MAI5 379 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 MROH9Q5TGP6 573 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIRREL2Q6UWL6 708 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 COX15Q7KZN9 410 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ISCA2Q86U28 154 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM151BQ8IW70 566 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 KBTBD2Q8IY47 623 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNPY4Q8N129 248 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDPRQ8NCN5 879 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR11G2Q8NGC1 345 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 DCAKDQ8WVC6 231 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 NEIL2Q969S2 332 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TM4SF19Q96DZ7 209 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 GPR78Q96P69 363 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 LMF1Q96S06 567 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATOH8Q96SQ7 321 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAFAH2Q99487 392 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM79Q9BSE2 394 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLC26A1Q9H2B4 701 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNX15Q9NRS6 342 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTGFRNQ9P2B2 879 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTSFQ9UBX1 484 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 SEC14L3Q9UDX4 400 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 FETUBQ9UGM5 382 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF180Q9UJW8 692 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNA1CQ13936 2221 aa10.26□□□□□ -0.77
APOBEC3C-202ENST00000428892 FBN2P35556 2912 aa10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms