RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399409.7

RABGGTA-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-202ENST00000399409 GPATCH2Q9NW75 528 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa22.15■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 A8MVJ9 347 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SPINT1O43278 529 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 PCDHGA12O60330 932 aa22.14■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 MLIPQ5VWP3 458 aa22.14■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 TRIM39Q9HCM9 518 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 RASSF1Q9NS23 344 aa22.14■■□□□ 1.14
RABGGTA-202ENST00000399409 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.14■■□□□ 1.14
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RABGGTA-202ENST00000399409 P3H2Q8IVL5 708 aa22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 SLC30A8Q8IWU4 369 aa22.14■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 C1GALT1Q9NS00 363 aa22.14■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 PI15O43692 258 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 ZNF852Q6ZMS4 543 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR10G2Q8NGC3 310 aa22.13■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 OR8D1Q8WZ84 308 aa22.12■■□□□ 1.13
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RABGGTA-202ENST00000399409 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 ARRDC3Q96B67 414 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 PPP1R16AQ96I34 528 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 RHNO1Q9BSD3 238 aa22.11■■□□□ 1.13
RABGGTA-202ENST00000399409 NOTCH4Q99466 2003 aa22.11■■□□□ 1.13
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