RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393392.6

ANKRD42-203, Transcript of ankyrin repeat domain 42, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD42, Length 2,302 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD42-203ENST00000393392 MMP21Q8N119 569 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 AMER3Q8N944 861 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.52e-6■■■■■ 33
ANKRD42-203ENST00000393392 NELL1Q92832 810 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 CGREF1Q99674 301 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 KLHL31Q9H511 634 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PIF1Q9H611 641 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ADGRE2Q9UHX3 823 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 DOLKQ9UPQ8 538 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 USP22Q9UPT9 525 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 TMEM131Q92545 1883 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 A0A1B0GVT2 93 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 C4orf51C9J302 202 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 VILLO15195 856 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 CCNDBP1O95273 360 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 GSNP06396 782 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PVRP15151 417 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 BSGP35613 385 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 KIR3DL1P43629 444 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 LSSP48449 732 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PLA2G16P53816 162 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 TAS2R50P59544 299 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 HYAL2Q12891 473 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 GPR180Q86V85 440 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PAQR7Q86WK9 346 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 IFNEQ86WN2 208 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 C16orf78Q8WTQ4 265 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ZFPM2Q8WW38 1151 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 RSC1A1Q92681 617 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 SLC22A18Q96BI1 424 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 IKZF5Q9H5V7 419 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 OCEL1Q9H607 264 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 TMEM74BQ9NUR3 256 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 HRASLS2Q9NWW9 162 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 UBAP1Q9NZ09 502 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ERVK-11Q9UQG0 969 aa11.91□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 LRIT2A6NDA9 550 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 NDUFS4O43181 175 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 AQP9O43315 295 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PRMT3O60678 531 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 CLEC3AO75596 197 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 C1QCP02747 245 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 HOXA6P31267 233 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ASMTP46597 345 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 C21orf59P57076 290 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ZNF385BQ569K4 471 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 WDR45BQ5MNZ6 344 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 GKN2Q86XP6 184 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 CLECL1Q8IZS7 167 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ARL14Q8N4G2 192 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ASB9Q96DX5 294 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 SPASTQ9UBP0 616 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 EGFL7Q9UHF1 273 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 SNX7Q9UNH6 387 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa11.9□□□□□ -0.5
ANKRD42-203ENST00000393392 ZW10O43264 779 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 LAMTOR5O43504 91 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 SCN2BO60939 215 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 SEMA3DO95025 777 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 NPPAP01160 153 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 SERPINB1P30740 379 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 GSK3BP49841 420 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 C21orf58P58505 322 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 LIPEQ05469 1076 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 C2orf80Q0P641 193 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 ZIC1Q15915 447 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 PRSS53Q2L4Q9 553 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 FCRL6Q6DN72 434 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 FBXO42Q6P3S6 717 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 SPATA24Q86W54 205 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 MARVELD2Q8N4S9 558 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 C17orf62Q9BQA9 187 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 SH3BP4Q9P0V3 963 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa11.89□□□□□ -0.51
ANKRD42-203ENST00000393392 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.4 ms