RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393150.7

CASP4-201, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CASP4, Length 1,340 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-201ENST00000393150 PKLRP30613 574 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC26A3P40879 764 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PRKCIP41743 596 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GPR85P60893 370 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DYNLT1P63172 113 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PLGLB1Q02325 96 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NOMO1Q15155 1222 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FLYWCH1Q4VC44 716 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H3F3CQ6NXT2 135 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RGS9BPQ6ZS82 235 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CRLF3Q8IUI8 442 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CLDN19Q8N6F1 224 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CSNK1A1LQ8N752 337 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR2L8Q8NGY9 312 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TMEM158Q8WZ71 300 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 P3H4Q92791 437 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RAD51AP1Q96B01 352 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MFSD3Q96ES6 412 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CYTH2Q99418 400 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 YIPF4Q9BSR8 244 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FICDQ9BVA6 458 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NUP62CLQ9H1M0 184 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CDCP1Q9H5V8 836 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MMP25Q9NPA2 562 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 L3MBTL1Q9Y468 752 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DUSP10Q9Y6W6 482 aa7.39□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF839A8K0R7 811 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 AGAP14A8MT82 685 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 AQP7O14520 342 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 BCKDKO14874 412 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SGTAO43765 313 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NME2P1O60361 137 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PDE9AO76083 593 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 GOSR1O95249 250 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CCNDBP1O95273 360 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 AGTP01019 485 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CYP1A2P05177 515 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H2AFZP0C0S5 128 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TFEBP19484 476 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ACVR2AP27037 513 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PTGER1P34995 402 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HK2P52789 917 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NUP107P57740 925 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SKP1P63208 163 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HSPA14Q0VDF9 509 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PTK6Q13882 451 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FAM53BQ14153 422 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ITIH4Q14624 930 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PTPRCAPQ14761 206 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 KIR3DS1Q14943 382 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NSDHLQ15738 373 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 CCDC181Q5TID7 509 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SLC9A4Q6AI14 798 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF585AQ6P3V2 769 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H2AFVQ71UI9 128 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LMNTD1Q8N9Z9 388 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 RAPGEF5Q92565 580 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NRTNQ99748 197 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SYT11Q9BT88 431 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HES7Q9BYE0 225 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LIME1Q9H400 295 aa7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 OR14I1A6ND48 311 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 LRRC10BA6NIK2 292 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HACD1B0YJ81 288 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NPIPA2E9PIF3 369 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 NPIPA3F8WFD2 350 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H0YGG7 62 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 H0YIG0 161 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DVL2O14641 736 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 KPNA5O15131 536 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 PEX1O43933 1283 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HS6ST1O60243 411 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 SMPD2O60906 423 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 HPXP02790 462 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 KRT1P04264 644 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 IL10P22301 178 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 DCAF7P61962 342 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 XIAPP98170 497 aa7.37□□□□□ -1.23
CASP4-201ENST00000393150 MYL5Q02045 173 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms